[发明专利]鉴定金圆2号小冬瓜杂种种子纯度的SSR分子标记引物在审
| 申请号: | 202010417449.3 | 申请日: | 2020-05-18 |
| 公开(公告)号: | CN111394505A | 公开(公告)日: | 2020-07-10 |
| 发明(设计)人: | 陈婕英;刘政国;欧伟红;陈庆明;程志魁;马连莲;苟纪权 | 申请(专利权)人: | 广西大学;南宁科农种苗有限责任公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司: | 南宁市吉昌知识产权代理事务所(普通合伙) 45125 | 代理人: | 滕艺琼 |
| 地址: | 530004 广西壮族*** | 国省代码: | 广西;45 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 鉴定 冬瓜 杂种 种子 纯度 ssr 分子 标记 引物 | ||
1.一种鉴定金圆2号小冬瓜杂种种子纯度的SSR分子标记引物,其特征在于,所述SSR分子标记引物为XD-18引物,所述XD-18引物序列为:上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
2.一种如权利要求1所述SSR分子标记引物在鉴定金圆2号小冬瓜杂种种子纯度中的应用。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于:所述SSR分子标记引物鉴定的金圆2号小冬瓜杂种种子母本为YMY-24-1,父本为YO-16-1。
4.一种使用如权利要求1所述SSR分子标记引物鉴定金圆2号小冬瓜杂种种子纯度的方法,其特征在于,步骤如下:
(1)取金圆2号小冬瓜(F1)种子、YMY-24-1(母本)种子、YO-16-1(父本)种子,然后将各种子培养至子叶展开用于单粒提取DNA样品,用CTAB法对各样品提取基因组DNA,并采用琼脂糖凝胶电泳检测DNA的纯度和完整性;
(2)PCR扩增及电泳分析:以步骤(1)提取的DNA为模板,以SSR分子标记引物进行PCR扩增,PCR扩增后的DNA采用聚丙烯酰胺凝胶电泳,并进行银染检测和条带记录;
(3)SSR分子标记引物对YMY-24-1(母本)扩增出200bp和170bp的特征谱带,对YO-16-1(父本)扩增出180bp和150bp的特征谱带,F1代鉴定结果中具有父本和母本特征带的即为真杂种,而只具有母本或者父本特征带的后代为假杂种或自交种。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:步骤(1)中以改良的CTAB法提取各样品的DNA。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:步骤(1)采用0.8%的琼脂糖凝胶电泳检测DNA的纯度和完整性;步骤(2)中PCR扩增后的DNA采用8%聚丙烯酰胺凝胶电泳。
7.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:步骤(2)的PCR体系为:PCR反应体系20μL,包括10μL的2×Taq Master Mix for PAGE,2μL的DNA模板(50ng·μL-1),2μL正、反向SSR分子标记引物(50ng·μL-1),6μL的ddH2O。
8.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,步骤(2)的PCR扩增程序为:95℃预变性5min;95℃变性30s;56℃退火45s;72℃延伸1min 30s;循环35次,最后72℃再延伸7min,4℃保存。
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