[发明专利]与猪肉质导电率性状相关的SNP分子标记及其应用

说明书

本发明公开的SNP分子标记WU_10.2_7_36255497与猪肉导电率性状相关，是一个新的分子标记，通过确定该猪SNP分子标记WU_10.2_7_36255497的突变位点的基因型对猪肉质导电率性状进行早期选择，可以节省生产成本并加快遗传进展，应用于种猪的选育中进一步完善猪肉质性状的育种分子标记，为改善猪肉品质提供有效的手段。

技术领域

本发明涉及基因检测技术领域，特别涉及一种与猪肉质导电率性状相关的SNP分子标记及其应用。

背景技术

我国是一个养猪大国，同时也是一个猪肉消费大国，在过去的几十年里，人们仅关注猪的生长性状，如饲料利用率、瘦肉率等，而往往忽略了肉质性状，导致猪肉品质下降。随着人们生活水平的提高，人们对猪肉品质的要求到了从数量到质量的转变阶段，因此猪肉质性状已成为一个重要的经济性状，越来越受到国内外养猪企业和种猪改良公司的广泛关注。

电导率是影响猪肉新鲜度的重要肉质性状之一，现我国主要以感官检查和挥发性盐基总氮(TVB-N)测定作为肉质新鲜度指标，而感官检查容易受到个人因素的影响，挥发性盐基总氮(TVB-N)测定虽是评价猪肉品质新鲜度的重要客观指标，但该方法耗时，操作十分复杂，不利于快速检测猪肉的新鲜度。然而，现时通过导电率判断猪肉新鲜度的检测方式，只是被动地获得猪肉的导电率，而仍未出现将猪肉质导电率性状应用于种猪的选育，以改善猪肉品质的报道。

发明内容

本发明的目的在于针对上述现有技术的不足，提供与猪肉质导电率性状相关的SNP分子标记及其应用，通过检测该分子标记突变位点的基因型，可应用于种猪的选育，以节省生产成本并加快遗传进展，为改善猪肉品质提供有效的手段。

本发明所采取的技术方案是：与猪肉质导电率性状相关的SNP分子标记，其所述SNP分子标记为WU_10.2_7_36255497，猪参考基因组为Sscrofa11.1，该标记不同基因型种猪的肉质导电率有显著差异。本发明公开的SNP分子标记，参阅Ensembl数据库(http://asia.ensembl.org/Sus_scrofa/Search/New？db＝core)，得到登录号为WU_10.2_7_36255497的基因片段(RS为rs322493994)，SNP分子标记位于猪7号染色体31181718bp位置，且属于ZNF76基因的内含子上，该位置为一个TC突变(突变位点)，TC即T为大频率的等位基因，C为小频率的等位基因，符号为等位基因频率大小，该SNP分子标记在突变位点上下游100bp序列如下：

5’-TATGTCTGTATCTCTGCCTCCCCCCTTCTCCCTGATTATATCTCCTCTTGTCATTCTTCTTGCCTCTCTTCTCTGTCTCCTCCATGGTGCTGTAGTGTGT(T/C)CTTACACACAACAGACTTCACACTTCTGAGAGTAGAGCTGGCCTTCAGGAACCAGACGAGCGTTGTGCTGAAAGGCAGCTCACTTGCCGGTGAGCTTCTC-3’；当上述核苷酸序列的第101位核苷酸为T时，猪显著降低肉质导电率，5’-和-3’分别表示核苷酸序列的5’端和3’端。

上述WU_10.2_7_36255497标记TT基因型比CC基因型种猪个体间的肉质电导率显著降低了18.30％，所以，T是有利于显著降低肉质电导率的等位基因。

本发明所采取的另一个技术方案是：与猪肉质导电率性状相关的SNP分子标记在猪遗传育种中的应用，其具体为一种猪肉质性状早期选择的方法，包括如下操作步骤：

1)检测得到种猪SNP分子标记WU_10.2_7_36255497的基因型；

2)基于检测得到的基因型对猪肉质导电率进行早期选择，其中TT基因型的导电率显著低于TC基因型和CC基因型的导电率，选留TT基因型的种猪。