[发明专利]副溶血性弧菌的PMA-qPCR检测方法在审
申请号: | 202010324994.8 | 申请日: | 2020-04-23 |
公开(公告)号: | CN111500752A | 公开(公告)日: | 2020-08-07 |
发明(设计)人: | 陈光哲;曾德新;周昊;谢青轩;沈嘉敏 | 申请(专利权)人: | 江苏省农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/63 |
代理公司: | 北京德崇智捷知识产权代理有限公司 11467 | 代理人: | 王斌 |
地址: | 210014 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 溶血 弧菌 pma qpcr 检测 方法 | ||
1.一种副溶血性弧菌的PMA-qPCR检测方法,其特征在于,所述检测方法采用PMA对菌液预处理后提取菌体DNA,再进行qPCR扩增,根据荧光数据的Ct值判断检测结果。
2.根据权利要求1所述的副溶血性弧菌的PMA-qPCR检测方法,其特征在于,所述检测方法包括以下步骤:
1)利用PMA对菌液进行预处理,使PMA与死亡或细胞膜损伤菌体DNA交联;
2)提取菌体DNA;
3)采用特异性引物对步骤2)提取的DNA模板进行qPCR扩增,采用的引物和探针的序列如下:
上游引物toxR-F:5’-AACGATCGTAGAGCCGTCTT-3’
下游引物toxR-R:5’-CTCACCAATCTGACGGAACTG-3’
探针toxR-P:FAM-5’-ACGCAATCGTTGAACCAGAAGCGCCA-3’–TAMRA;
4)采集荧光信号,得到qPCR产物的Ct值,Ct值≤35的样本为阳性,Ct值显示为无的样本为阴性;35<Ct值≤40,判为可疑样品,对于可疑样品,先看扩增曲线,如果扩增曲线为对数扩增曲线,则为可疑阳性,否则判为阴性;对于可疑阳性样品,重新提取核酸进行检测,如果重复扩增曲线为对数扩增曲线,判为阳性,否则判为阴性。
3.根据权利要求2所述的副溶血性弧菌的PMA-qPCR检测方法,其特征在于,步骤1)具体为:样品接种至碱性蛋白胨水中,36℃振荡孵育6h-18h,菌液离心后用PBS缓冲液洗涤2-3次后菌重悬于PBS中,在避光条件下向重悬菌液中加入PMA工作液,使其终浓度为4μM,充分混匀后,避光处理、间隔振动,再置于40w光照强度下照射3min。
4.根据权利要求2所述的副溶血性弧菌的PMA-qPCR检测方法,其特征在于,所述qPCR扩增反应条件为:95℃预变性30sec,每个循环为:95℃,5sec;60℃,34sec;40个循环。
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