[发明专利]一种鉴定黄瓜种质真实性的SNP位点引物组合及应用

权利要求书

1.鉴定黄瓜种质真实性的核心SNP引物组，所述SNP引物组用于分别扩增如下SNP位点组；

所述SNP位点组由如下第一SNP位点到第四十八SNP位点组成：

第一SNP位点，所述第一SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第215528位，该位点的核苷酸碱基为G或A；

第二SNP位点，所述第二SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第6591765位，该位点的核苷酸碱基为A或T；

第三SNP位点，所述第三SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第18360230位，该位点的核苷酸碱基为G或C；

第四SNP位点，所述第四SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第19328118位，该位点的核苷酸碱基为T或C；

第五SNP位点，所述第五SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第21471767位，该位点的核苷酸碱基为G或C；

第六SNP位点，所述第六SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第26006098位，该位点的核苷酸碱基为A或G；

第七SNP位点，所述第七SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第430448位，该位点的核苷酸碱基为C或T；

第八SNP位点，所述第八SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第6544548位，该位点的核苷酸碱基为A或T；

第九SNP位点，所述第九SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第7082492位，该位点的核苷酸碱基为A或T；

第十SNP位点，所述第十SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第13016733位，该位点的核苷酸碱基为C或T；

第十一SNP位点，所述第十一SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第19736406位，该位点的核苷酸碱基为C或T；

第十二SNP位点，所述第十二SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第22890765位，该位点的核苷酸碱基为C或T；

第十三SNP位点，所述第十三SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第3674759位，该位点的核苷酸碱基为G或A；

第十四SNP位点，所述第十四SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第6715343位，该位点的核苷酸碱基为T或C；

第十五SNP位点，所述第十五SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第8251132位，该位点的核苷酸碱基为G或A；

第十六SNP位点，所述第十六SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第17274568位，该位点的核苷酸碱基为G或A；

第十七SNP位点，所述第十七SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第28481554位，该位点的核苷酸碱基为C或T；

第十八SNP位点，所述第十八SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第30072485位，该位点的核苷酸碱基为A或G；

第十九SNP位点，所述第十九SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第31558451位，该位点的核苷酸碱基为A或G；

第二十SNP位点，所述第二十SNP位点位于黄瓜参考基因组第4染色体第1284842位，该位点的核苷酸碱基为G或T；

第二十一SNP位点，所述第二十一SNP位点位于黄瓜参考基因组第4染色体第14339957位，该位点的核苷酸碱基为A或G；

第二十二SNP位点，所述第二十二SNP位点位于黄瓜参考基因组第4染色体第16172836位，该位点的核苷酸碱基为A或G；

第二十三SNP位点，所述第二十三SNP位点位于黄瓜参考基因组第4染色体第20428654位，该位点的核苷酸碱基为G或A；

第二十四SNP位点，所述第二十四SNP位点位于黄瓜参考基因组第4染色体第22774845位，该位点的核苷酸碱基为G或A；

第二十五SNP位点，所述第二十五SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第1045863位，该位点的核苷酸碱基为T或G；

第二十六SNP位点，所述第二十六SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第4850607位，该位点的核苷酸碱基为G或A；

第二十七SNP位点，所述第二十七SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第5787330位，该位点的核苷酸碱基为T或A；

第二十八SNP位点，所述第二十八SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第11869197位，该位点的核苷酸碱基为G或C；

第二十九SNP位点，所述第二十九SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第15556517位，该位点的核苷酸碱基为T或G；

第三十SNP位点，所述第三十SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第23713010位，该位点的核苷酸碱基为T或C；

第三十一SNP位点，所述第三十一SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第24681408位，该位点的核苷酸碱基为C或A；

第三十二SNP位点，所述第三十二SNP位点位于黄瓜参考基因组第6染色体第437035位，该位点的核苷酸碱基为G或C；

第三十三SNP位点，所述第三十三SNP位点位于黄瓜参考基因组第6染色体第6311543位，该位点的核苷酸碱基为T或G；

第三十四SNP位点，所述第三十四SNP位点位于黄瓜参考基因组第6染色体第7644442位，该位点的核苷酸碱基为T或C；

第三十五SNP位点，所述第三十五SNP位点位于黄瓜参考基因组第6染色体第8554160位，该位点的核苷酸碱基为C或T；

第三十六SNP位点，所述第三十六SNP位点位于黄瓜参考基因组第6染色体第9796426位，该位点的核苷酸碱基为G或A；

第三十七SNP位点，所述第三十七SNP位点位于黄瓜参考基因组第6染色体第11577012位，该位点的核苷酸碱基为T或G；

第三十八SNP位点，所述第三十八SNP位点位于黄瓜参考基因组第6染色体第13951516位，该位点的核苷酸碱基为T或A；

第三十九SNP位点，所述第三十九SNP位点位于黄瓜参考基因组第6染色体第18948506位，该位点的核苷酸碱基为G或A；

第四十SNP位点，所述第四十SNP位点位于黄瓜参考基因组第6染色体第24605064位，该位点的核苷酸碱基为A或T；

第四十一SNP位点，所述第四十一SNP位点位于黄瓜参考基因组第7染色体第4474790位，该位点的核苷酸碱基为C或T；

第四十二SNP位点，所述第四十二SNP位点位于黄瓜参考基因组第7染色体第6777921位，该位点的核苷酸碱基为C或A；

第四十三SNP位点，所述第四十三SNP位点位于黄瓜参考基因组第7染色体第7779724位，该位点的核苷酸碱基为G或A；

第四十四SNP位点，所述第四十四SNP位点位于黄瓜参考基因组第7染色体第9945305位，该位点的核苷酸碱基为T或C；

第四十五SNP位点，所述第四十五SNP位点位于黄瓜参考基因组第7染色体第10495910位，该位点的核苷酸碱基为A或G；

第四十六SNP位点，所述第四十六SNP位点位于黄瓜参考基因组第7染色体第11918569位，该位点的核苷酸碱基为C或T；

第四十七SNP位点，所述第四十七SNP位点位于黄瓜参考基因组第7染色体第12580918位，该位点的核苷酸碱基为G或A；

第四十八SNP位点，所述第四十八SNP位点位于黄瓜参考基因组第7染色体第14166928位，该位点的核苷酸碱基为A或G；

所述黄瓜参考基因组为ChineseLong V2；

所述SNP引物组包括：

第一SNP引物组，用于扩增所述第一SNP位点；第二SNP引物组，用于扩增所述第二SNP位点；第三SNP引物组，用于扩增所述第三SNP位点；第四SNP引物组，用于扩增所述第四SNP位点；第五SNP引物组，用于扩增所述第五SNP位点；第六SNP引物组，用于扩增所述第六SNP位点；第七SNP引物组，用于扩增所述第七SNP位点；第八SNP引物组，用于扩增所述第八SNP位点；第九SNP引物组，用于扩增所述第九SNP位点；第十SNP引物组，用于扩增所述第十SNP位点；第十一SNP引物组，用于扩增所述第十一SNP位点；第十二SNP引物组，用于扩增所述第十二SNP位点；第十三SNP引物组，用于扩增所述第十三SNP位点；第十四SNP引物组，用于扩增所述第十四SNP位点；第十五SNP引物组，用于扩增所述第十五SNP位点；第十六SNP引物组，用于扩增所述第十六SNP位点；第十七SNP引物组，用于扩增所述第十七SNP位点；第十八SNP引物组，用于扩增所述第十八SNP位点；第十九SNP引物组，用于扩增所述第十九SNP位点；第二十SNP引物组，用于扩增所述第二十SNP位点；第二十一SNP引物组，用于扩增所述第二十一SNP位点；第二十二SNP引物组，用于扩增所述第二十二SNP位点；第二十三SNP引物组，用于扩增所述第二十三SNP位点；第二十四SNP引物组，用于扩增所述第二十四SNP位点；第二十五SNP引物组，用于扩增所述第二十五SNP位点；第二十六SNP引物组，用于扩增所述第二十六SNP位点；第二十七SNP引物组，用于扩增所述第二十七SNP位点；第二十八SNP引物组，用于扩增所述第二十八SNP位点；第二十九SNP引物组，用于扩增所述第二十九SNP位点；第三十SNP引物组，用于扩增所述第三十SNP位点；第三十一SNP引物组，用于扩增所述第三十一SNP位点；第三十二SNP引物组，用于扩增所述第三十二SNP位点；第三十三SNP引物组，用于扩增所述第三十三SNP位点；第三十四SNP引物组，用于扩增所述第三十四SNP位点；第三十五SNP引物组，用于扩增所述第三十五SNP位点；第三十六SNP引物组，用于扩增所述第三十六SNP位点；第三十七SNP引物组，用于扩增所述第三十七SNP位点；第三十八SNP引物组，用于扩增所述第三十八SNP位点；第三十九SNP引物组，用于扩增所述第三十九SNP位点；第四十SNP引物组，用于扩增所述第四十SNP位点；第四十一SNP引物组，用于扩增所述第四十一SNP位点；第四十二SNP引物组，用于扩增所述第四十二SNP位点；第四十三SNP引物组，用于扩增所述第四十三SNP位点；第四十四SNP引物组，用于扩增所述第四十四SNP位点；第四十五SNP引物组，用于扩增所述第四十五SNP位点；第四十六SNP引物组，用于扩增所述第四十六SNP位点；第四十七SNP引物组，用于扩增所述第四十七SNP位点；第四十八SNP引物组，用于扩增所述第四十八SNP位点；

所述SNP引物组应用于标准黄瓜种质，所述标准黄瓜种质选自以下105个黄瓜种质：

北京小刺瓜，CM8537，抚松叶三，青皮八杈，大青 7314-2-6-1-1，辽通密刺，黄铁无刺瓜，bvrc1，前七里黄瓜，叶三白，辽阳叶三，新泰密刺，bvrc2，bvrc3，bvrc4，青岛秋叶儿三，KagaFushinari，Sagami HanpakuFushinariKyuri，AonagaSuyoKyuri，Tsuda，SakataNatsusango，Honshu Aibai，Sekino No. 2，CGN19828，bvrc5，大刺黄瓜，秋黄瓜，冷露，bvrc6，bvrc7，bvrc8，四川白瓜，bvrc9，bvrc10，bvrc11，津研2号，Hok，151G，NemetKigyo，KecskemetiHamvas，M 5，752，Gy 3，Muromskij，AltaiskyRanny，A-C-3，Ames 1208，KlinskyMestnyj，65G，bvrc12，8181，Puerta-Rico #6，1972 B-2，SC 53-B，2163，SC 50，NationalPickle，Spartan Garden MSU-C7-63，GY14，Khiar，Rasht，WJR2930，9748，N2/81，7037A，7088D，7123C，7237A，7354A，AM56，CG6647，RenR12，RenR27，RenR44，RenR54，RenR57，G421，H19，Space Master，京研35，MB，D5，D31，Ou8，秋棚，TrueLemon，WCC8，WI2757，bvrc13，bvrc14，bvrc15，bvrc16，bvrc17，bvrc18，bvrc19，bvrc20，bvrc21，bvrc22，bvrc23，bvrc24，bvrc25，bvrc26，bvrc27，bvrc28，bvrc29。