[发明专利]一种基于3D Unet的动态双示踪PET成像方法有效
| 申请号: | 202010285064.6 | 申请日: | 2020-04-13 |
| 公开(公告)号: | CN111476859B | 公开(公告)日: | 2022-09-16 |
| 发明(设计)人: | 刘华锋;卿敏敏 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
| 主分类号: | G06T11/00 | 分类号: | G06T11/00;G06T19/00;G06N3/04;G06N3/08 |
| 代理公司: | 杭州天勤知识产权代理有限公司 33224 | 代理人: | 王琛 |
| 地址: | 310013 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 基于 unet 动态 双示踪 pet 成像 方法 | ||
1.一种基于3D Unet的动态双示踪PET成像方法,包括如下步骤:
(1)对注入有混合双示踪剂的生物组织进行动态PET探测,得到对应不同时刻的符合计数向量,进而组成反映混合双示踪剂分布情况的动态符合计数序列Ydual,所述混合双示踪剂由两种不同的示踪剂I和示踪剂II所组成;
(2)对先后注入有示踪剂I和示踪剂II的生物组织进行动态PET探测,分别得到两组单示踪剂对应不同时刻的符合计数向量,进而组成分别反映示踪剂I和示踪剂II分布情况的动态符合计数序列YI和YII;
(3)利用PET图像重建算法计算出动态符合计数序列Ydual、YI和YII所对应的动态PET图像序列Xdual、XI和XII;
(4)使Xdual、XI和XII组成作为一个样本,根据步骤(1)~(3)重复执行多次以得到大量样本,进而将所有样本分为训练集和测试集;
(5)利用训练集样本作为输入对3D Unet神经网络进行训练,得到动态双示踪剂PET重建模型;
所述3D Unet神经网络从输入至输出由三个下采样块D1~D3、上采样块U1、concat层C1、上采样块U2、concat层C2、上采样块U3、concat层C3、一个卷积块和一个3D卷积层H依次连接组成;
所述下采样块D1包含有七层结构:第一层为3D卷积层,其设置3×3×3大小的卷积核,产生8个Feature map;第二层为BatchNorm层,对上一层的输出进行归一化;第三层为LeakyRelu层,对上一层的输出做激活函数处理;第四层为3D卷积层,其设置3×3×3大小的卷积核,产生8个Feature map;第五层为BatchNorm层,对上一层的输出进行归一化;第六层为Leaky Relu层,对上一层的输出做激活函数处理,其输出作为concat层C3的输入;第七层为3D最大池化层,设置2×2×2大小的卷积核进行下采样,产生8个Feature map;
所述下采样块D2包含有七层结构:第一层为3D卷积层,其设置3×3×3大小的卷积核,产生16个Feature map;第二层为BatchNorm层,对上一层的输出进行归一化;第三层为Leaky Relu层,对上一层的输出做激活函数处理;第四层为3D卷积层,其设置3×3×3大小的卷积核,产生16个Feature map;第五层为BatchNorm层,对上一层的输出进行归一化;第六层为Leaky Relu层,对上一层的输出做激活函数处理,其输出作为concat层C2的输入;第七层为3D最大池化层,设置3×2×2大小的卷积核进行下采样,产生16个Feature map;
所述下采样块D3包含有七层结构:第一层为3D卷积层,其设置3×3×3大小的卷积核,产生32个Feature map;第二层为BatchNorm层,对上一层的输出进行归一化;第三层为Leaky Relu层,对上一层的输出做激活函数处理;第四层为3D卷积层,其设置3×3×3大小的卷积核,产生32个Feature map;第五层为BatchNorm层,对上一层的输出进行归一化;第六层为Leaky Relu层,对上一层的输出做激活函数处理,其输出作为concat层C1的输入;第七层为3D最大池化层,设置1×2×2大小的卷积核进行下采样,产生32个Feature map;
所述上采样块U1包含有九层结构:第一层为3D卷积层,其设置3×3×3大小的卷积核,产生64个Feature map;第二层为BatchNorm层,对上一层的输出进行归一化;第三层为Leaky Relu层,对上一层的输出做激活函数处理;第四层为3D卷积层,其设置3×3×3大小的卷积核,产生64个Feature map;第五层为BatchNorm层,对上一层的输出进行归一化;第六层为Leaky Relu层,对上一层的输出做激活函数处理;第七层为3D反卷积层,其设置1×2×2大小的卷积核,产生32个Feature map;第八层为BatchNorm层,对上一层的输出进行归一化;第九层为Leaky Relu层,对上一层的输出做激活函数处理;
所述上采样块U2包含有九层结构:第一层为3D卷积层,其设置3×3×3大小的卷积核,产生32个Feature map;第二层为BatchNorm层,对上一层的输出进行归一化;第三层为Leaky Relu层,对上一层的输出做激活函数处理;第四层为3D卷积层,其设置3×3×3大小的卷积核,产生32个Feature map;第五层为BatchNorm层,对上一层的输出进行归一化;第六层为Leaky Relu层,对上一层的输出做激活函数处理;第七层为3D反卷积层,其设置3×2×2大小的卷积核,产生16个Feature map;第八层为BatchNorm层,对上一层的输出进行归一化;第九层为Leaky Relu层,对上一层的输出做激活函数处理;
所述上采样块U3包含有九层结构:第一层为3D卷积层,其设置3×3×3大小的卷积核,产生16个Feature map;第二层为BatchNorm层,对上一层的输出进行归一化;第三层为Leaky Relu层,对上一层的输出做激活函数处理;第四层为3D卷积层,其设置3×3×3大小的卷积核,产生16个Feature map;第五层为BatchNorm层,对上一层的输出进行归一化;第六层为Leaky Relu层,对上一层的输出做激活函数处理;第七层为3D反卷积层,其设置2×2×2大小的卷积核,产生8个Feature map;第八层为BatchNorm层,对上一层的输出进行归一化;第九层为Leaky Relu层,对上一层的输出做激活函数处理;
所述concat层C1将上采样块U1的输出以及下采样块D3第六层的输出在channel维度方向上进行连接后作为上采样块U2的输入;所述concat层C2将上采样块U2的输出以及下采样块D2第六层的输出在channel维度方向上进行连接后作为上采样块U3的输入;所述concat层C3将上采样块U3的输出以及下采样块D1第六层的输出在channel维度方向上进行连接后作为卷积块的输入;
所述卷积块包含有六层结构:第一层为3D卷积层,其设置3×3×3大小的卷积核,产生8个Feature map;第二层为BatchNorm层,对上一层的输出进行归一化;第三层为Leaky Relu层,对上一层的输出做激活函数处理;第四层为3D卷积层,其设置3×3×3大小的卷积核,产生8个Feature map;第五层为BatchNorm层,对上一层的输出进行归一化;第六层为LeakyRelu层,对上一层的输出做激活函数处理,其输出作为3D卷积层H的输入;
所述3D卷积层H设置1×1×1大小的卷积核,产生1个Feature map作为整个网络的输出,即为两种示踪剂对应的动态PET图像序列XI和XII在时间维度上的串联;
(6)从测试集中任取一样本,使该样本中的Xdual在时间维度复制连接构成[Xdual,Xdual]后输入至所述动态双示踪剂PET重建模型,即可输出得到对应示踪剂I和示踪剂II的动态PET图像序列XI和XII。
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