[发明专利]一种分离的RNA及其DNA模板的合成方法

说明书

本发明公开了一种分离的RNA及其DNA模板的合成方法，涉及生物分子技术领域，具体而言，该分离的RNA为利于SNHG17的功能及肿瘤的调控机制提供了一种新的研究途径。

技术领域

本发明涉及生物分子技术领域，具体而言，涉及一种分离的RNA及其DNA模板的合成方法。

背景技术

癌症研究主要集中在蛋白质编码基因的遗传改变，对非编码基因认识很少。近些年，随着高通量测序技术的发展，非编码RNA从“垃圾物质”变为被认为具有多种调控功能的基因。

长链非编码RNA(lncRNA)是非编码RNA的最重要的一类，lncRNA是长度大于200个核苷酸的RNA，根据不同功能，lncRNA包括抑癌基因和癌基因，参与多种癌症的发生发展，开发具有重要功能的lncRNA研究靶点，对于肿瘤患者的诊断及治疗具有重要意义。

目前对lncRNA功能研究主要在转录后调控和染色质修饰等多种生物学进展。lncRNA表达失调能够调节肿瘤的发生和转移，例如，HOTAIR、HULC、LINC00152、MALAT1、H19、GHET1和GACAT3等已经被证明是较好的致癌基因靶点，而如LEIGC、GAS5和FER1L4。

小核RNA(small nucleolar RNAs,snoRNAs)被认为是蛋白质合成机制中重要的组成部分。这些非编码RNA在调控细胞命运和肿瘤发生方面发挥关键作用。同时，也有报道证明snoRNAs的宿主基因也能促进癌症的发展，它们贮存于长链非编码RNA(long non-codingRNA，lncRNA)和非蛋白编码基因的内含子区，小核RNA宿主基因17(small nucleolar RNAhost gene 17，SNHG17)是这些宿主基因中的一员。

SNHG17基因定位于20号染色体p12上，ensemble数据库显示SNHG17基因有9条转录本，主要定位在细胞核内。SNHG亚型众多，而SNHG17功能及对肿瘤的调控机制研究缺鲜有报道，且体外转录很难合成RNA，有许多因素会导致转录失败，例如模板不纯等。

鉴于此，提出本申请。

发明内容

本发明的目的在于提供一种分离的RNA及其DNA模板的合成方法，为SNHG17功能及对肿瘤的调控机制研究提供一种新的途径。

第一方面，本发明实施例提供了一种分离的RNA，其碱基序列如SEQ ID No.1所示。

第二方面，本发明实施例提供了一种DNA片段，其能够转录如前述实施例所述的分离的RNA。

第三方面，本发明实施例提供了一种重组载体，其含有如前述实施例所述的DNA片段。

第四方面，本发明实施例提供了一种宿主细胞，其含有如前述实施例所述的重组载体。

第五方面，本发明实施例提供了一种核酸组合物，其包括用于扩增如前述实施例所述的分离的RNA的引物组合物。

第六方面，本发明实施例提供了一种如前述实施例所述的分离的RNA的DNA模板的合成方法，其包括采用如前述实施例所述的核酸组合物对分离的RNA或含有所述分离的RNA的载体进行扩增，以获得所述分离的RNA的体外转录的DNA模板。

第七方面，本发明实施例提供了一种用于体外合成如前述实施例所述的分离的RNA的方法，其包括采用如前述实施例所述的分离的RNA的DNA模板的合成方法合成的DNA模板进行体外转录。

第八方面，本发明实施例提供了一种用于分析或诊断肿瘤的试剂盒，其包括如前述实施例所述的核酸组合物。

第九方面，本发明实施例提供了如前述实施例所述的核酸组合物在制备用于分析或诊断肿瘤的试剂盒中的应用。

本发明提供的技术方案的有益效果是：