[发明专利]一种利用二代和三代转录组测序数据的基因组注释方法

权利要求书

1.一种利用二代和三代转录组测序数据的基因组注释方法，其特征在于，包括下述步骤：

步骤1：将三代全长转录组测序序列比对到目标基因组，得到各编码基因的初始结构信息；

步骤2：将二代转录组测序短序列比对到目标基因组，从比对文件中提取内含子剪切位点信息；

步骤3：结合各编码基因的初始结构信息和内含子剪切位点信息，获得各编码基因的最终结构信息；

所述步骤1包括下述步骤：

步骤1.1：预测三代全长转录组测序序列的蛋白编码序列：对三代全长转录组测序序列进行分析得到全长非嵌合序列，预测全长非嵌合序列的蛋白编码序列；

步骤1.2：将蛋白编码序列比对到目标基因组：将预测得到的所有蛋白编码序列比对到目标基因组，获得比对结果文件；

步骤1.3：提取外显子序列并重新比对回目标基因组：根据比对结果文件及基因组文件提取各外显子序列，将各外显子序列比对回目标基因组，得到各编码基因的初始结构信息。