[发明专利]一套用于检测雪茄烟资源的KASP引物组及其应用

说明书

本发明提供了一套基于KASP的SNP标记及其应用，属于分子生物学、种质资源学和分子育种技术领域，所述SNP标记包括CigarSNP01‑1、CigarSNP01‑2、CigarSNP02‑1等共48个标记。采用本发明提供的SNP标记，完成雪茄烟SNP指纹图谱构建工作，能系统鉴定现有雪茄烟资源，并剔除重复收集的资源，建立雪茄烟品种知识产权保护机制。利用本发明提供的SNP标记筛选鉴定新收集的雪茄烟资源，审定新培育的雪茄烟品种，并利用到雪茄烟育种工作中。

技术领域

本发明属于分子生物学、种质资源学和分子育种技术领域，尤其涉及一套基于KASP的SNP标记及其应用。

背景技术

雪茄烟因其独有的风格特色、深厚的文化内涵和更高的吸食安全性，吸引着越来越多的消费者，近年来国内外市场需求日益增长，产业前景广阔。但是，我国雪茄烟研究工作起步晚，基础研究落后，各研究单位引进、收集、交换的雪茄烟资源、品种众多，存在同种异名或者同名异种的现象，非常不利于雪茄烟资源的管理和利用。且雪茄烟具体遗传背景尚不清楚，不能够有效快速的进行雪茄烟常规育种和分子育种工作。因此，对这些资源构建指纹图谱，剔除重复收集、引进的资源，为每份资源赋予独有的身份信息，对雪茄烟资源收集鉴定和品种分子审定意义重大。

目前，烟草种质资源依然采用第二代分子标记来进行指纹图谱构建工作。随着分子标记技术和第二代测序技术的快速发展，SNP标记和基因组学理论、方法不断深入到种质资源多样性检测和指纹图谱构建工作中。由于SNP标记具有覆盖全基因组、通量高、位点特异、共显性遗传、错误率低、开发和检测成本低等诸多优势，未来将成为高通量种质资源检测的重要标记类型。近年来，SNP标记已经广泛应用于小麦、水稻、玉米等大宗作物的指纹图谱构建和遗传进化分析上，目前尚未见到基于KASP技术的SNP分子标记来进行雪茄烟资源鉴定和品种审定的报导。

发明内容

有鉴于此，本发明的目的在于提供一套基于KASP的SNP标记及其应用，采用本发明提供的SNP标记，完成雪茄烟SNP指纹图谱构建工作，能系统鉴定现有雪茄烟资源，并剔除重复收集的资源，建立雪茄烟品种知识产权保护机制。利用本发明提供的SNP标记筛选鉴定新收集的雪茄烟资源，审定新培育的雪茄烟品种，并利用到雪茄烟育种工作中。

为了实现上述发明目的，本发明提供了以下技术方案：

本发明提供了一套基于KASP的SNP标记，所述SNP标记包括CigarSNP01-1、CigarSNP01-2、CigarSNP02-1、CigarSNP02-2、CigarSNP03-1、CigarSNP03-2、CigarSNP04-1、CigarSNP04-2、CigarSNP05-1、CigarSNP06-1、CigarSNP06-2、CigarSNP07-1、CigarSNP07-2、CigarSNP08-1、CigarSNP09-1、CigarSNP09-2、CigarSNP10-1、CigarSNP10-2、CigarSNP11-1、CigarSNP11-2、CigarSNP11-3、CigarSNP12-1、CigarSNP12-2、CigarSNP12-3、CigarSNP13-1、CigarSNP13-2、CigarSNP14-1、CigarSNP15-1、CigarSNP15-2、CigarSNP16-1、CigarSNP16-2、CigarSNP17-1、CigarSNP17-2、CigarSNP18-1、CigarSNP18-2、CigarSNP19-1、CigarSNP19-2、CigarSNP20-1、CigarSNP20-2、CigarSNP20-3、CigarSNP21-1、CigarSNP22-1、CigarSNP22-2、CigarSNP23-1、CigarSNP23-2、CigarSNP23-3、CigarSNP24-1和CigarSNP24-2。

优选的，所述CigarSNP01-1位于雪茄的染色体Nt01上，物理位置为20189161；

所述CigarSNP01-2位于雪茄的染色体Nt01上，物理位置为127733497；