[发明专利]一种基于RAA-CRISPR-cas13a检测HBV cccDNA的试剂盒在审
| 申请号: | 202010195047.3 | 申请日: | 2020-03-19 |
| 公开(公告)号: | CN113493855A | 公开(公告)日: | 2021-10-12 |
| 发明(设计)人: | 张向颖;任锋;李浩;周育森;田原;金荣华;段钟平;陈德喜;李伟华 | 申请(专利权)人: | 首都医科大学附属北京佑安医院 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12R1/93 |
| 代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 何叶喧 |
| 地址: | 100069 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 基于 raa crispr cas13a 检测 hbv cccdna 试剂盒 | ||
1.一种核酸分子组合物,由引物F1、引物R1和特异crRNA组成;
引物F1为序列表的序列1所示的单链DNA分子;
引物R1为序列表的序列2所示的单链DNA分子;
特异crRNA为序列表的序列3所示的单链RNA分子。
2.一种用于检测HBV cccDNA的试剂盒,包括权利要求1所述的核酸分子组合物。
3.如权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括不降解质粒的ATP依赖的DNA酶。
4.如权利要求2或3所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括LwCas13a蛋白。
5.如权利要求2或3或4所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括用于RAA扩增的试剂或试剂盒。
6.如权利要求2或3或4或5所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括记载有检测方法的载体;所述检测方法包括如下步骤:
(1)提取受试者肝脏组织的总DNA,然后进行PSAD消化;
(2)取步骤(1)的产物溶液,作为模板溶液,采用引物F1和引物R1组成的引物对进行RAA扩增;
(3)取步骤(2)的产物溶液,进行基于CRISPR-Cas13a系统的可视化检测;所述CRISPR-Cas13a系统的crRNA为所述特异crRNA。
7.权利要求1所述核酸分子组合物在制备试剂盒中的应用;所述试剂盒的用途为检测HBV cccDNA。
8.组件1、组件2、组件3和组件4在在制备试剂盒中的应用;所述试剂盒的用途为检测HBV cccDNA;
所述组件1为权利要求1所述核酸分子组合物;
所述组件2为不降解质粒的ATP依赖的DNA酶;
所述组件3为LwCas13a蛋白;
所述组件4为用于RAA扩增的试剂或试剂盒。
9.权利要求1所述核酸分子组合物在检测HBV cccDNA中的应用。
10.一种检测HBV cccDNA的方法,包括如下步骤:
(1)提取受试者肝脏组织的总DNA,然后进行PSAD消化;
(2)取步骤(1)的产物溶液,作为模板溶液,采用引物F1和引物R1组成的引物对进行RAA扩增;引物F1为序列表的序列1所示的单链DNA分子,引物R1为序列表的序列2所示的单链DNA分子;
(3)取步骤(2)的产物溶液,进行基于CRISPR-Cas13a系统的可视化检测;所述CRISPR-Cas13a系统中的crRNA如序列表的序列3所示。
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