[发明专利]一种碱基编辑工具及其用途有效
申请号: | 202010163058.3 | 申请日: | 2020-03-10 |
公开(公告)号: | CN111172133B | 公开(公告)日: | 2021-12-31 |
发明(设计)人: | 刘亚京;黄师圣;黄行许 | 申请(专利权)人: | 上海科技大学 |
主分类号: | C12N9/22 | 分类号: | C12N9/22;C12N15/55;C12N15/113;C12N15/85;C12N15/90 |
代理公司: | 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 | 代理人: | 严晨;许亦琳 |
地址: | 201210 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 碱基 编辑 工具 及其 用途 | ||
1.一种融合蛋白,所述融合蛋白自N端至C端依次包括第一nCas9片段、嵌合插入片段、第二nCas9片段和两个UGI片段,所述嵌合插入片段选自APOBEC1片段或APOBEC3A片段;
所述第一nCas9片段的氨基酸序列如SEQ ID NO. 1所示;以及,所述第二nCas9片段的氨基酸序列如SEQ ID NO. 2所示。
2.如权利要求1所述的融合蛋白,其特征在于,所述APOBEC1片段的氨基酸序列如SEQID NO. 3所示。
3.如权利要求1所述的融合蛋白,其特征在于,所述APOBEC3A片段的氨基酸序列如SEQID NO. 4所示。
4.如权利要求1所述的融合蛋白,其特征在于,所述UGI片段的氨基酸序列如SEQ IDNO. 5所示。
5.如权利要求1所述的融合蛋白,其特征在于,所述融合蛋白还包括核定位信号片段。
6.如权利要求5所述的融合蛋白,其特征在于,所述核定位信号片段的氨基酸序列如SEQ ID NO. 6所示。
7.如权利要求1所述的融合蛋白,其特征在于,所述融合蛋白还包括柔性连接肽片段。
8.如权利要求7所述的融合蛋白,其特征在于,所述柔性连接肽片段的氨基酸序列如SEQ ID NO. 7或SEQ ID NO. 8所示。
9.如权利要求1所述的融合蛋白,其特征在于,所述融合蛋白的氨基酸序列如SEQ IDNo. 9~10其中之一所示。
10.一种分离的多核苷酸,编码如权利要求1~9任一权利要求所述的融合蛋白。
11.一种构建体,所述构建体含有如权利要求10所述的分离的多核苷酸。
12.一种表达系统,所述表达系统含有如权利要求11所述的构建体或基因组中整合有外源的如权利要求10所述的多核苷酸。
13.如权利要求12所述的表达系统,其特征在于,所述表达系统的宿主细胞选自真核细胞。
14.如权利要求13所述的表达系统,其特征在于,所述真核细胞选自小鼠细胞或人细胞。
15.如权利要求14所述的表达系统,其特征在于,所述真核细胞选自小鼠脑神经瘤细胞、人胚胎肾细胞、或人宫颈癌细胞、人结肠癌细胞或人骨肉瘤细胞。
16.如权利要求15所述的表达系统,其特征在于,所述真核细胞选自N2a细胞、HEK293FT细胞、Hela细胞、HCT116细胞、或U2OS细胞。
17.如权利要求1~9任一权利要求所述的融合蛋白、如权利要求10所述的分离的多核苷酸、如权利要求11所述的构建体或如权利要求12~16任一权利要求所述的表达系统在基因编辑中的用途。
18.如权利要求17所述的用途,其特征在于,所述用途具体为在真核生物的基因编辑中的用途。
19.一种碱基编辑体系,包括如权利要求1~9任一权利要求所述的融合蛋白,所述碱基编辑体系还包括sgRNA。
20.一种基因编辑方法,包括:通过如权利要求1~9任一权利要求所述的融合蛋白、或如权利要求19所述的碱基编辑体系进行基因编辑。
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