[发明专利]DNA甲基化检测方法及相关应用在审
| 申请号: | 202010118248.3 | 申请日: | 2018-09-14 |
| 公开(公告)号: | CN111235238A | 公开(公告)日: | 2020-06-05 |
| 发明(设计)人: | 于浩洋;梁宁;吕禾 | 申请(专利权)人: | 深圳市晋百慧生物有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12Q1/6886 |
| 代理公司: | 广东君龙律师事务所 44470 | 代理人: | 吴娟 |
| 地址: | 518055 广东省深圳市*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | dna 甲基化 检测 方法 相关 应用 | ||
1.一种DNA甲基化检测方法,该方法包括:
(1)用甲基化敏感性限制性内切酶处理一部分DNA样本,
(2)对于经过所述酶处理过的DNA样本和未经所述酶处理的DNA样本,对待测DNA中含有至少一段所述酶所识别序列的序列进行扩增,
根据经过所述酶处理的DNA样本的扩增结果和未经所述酶处理的DNA样本的扩增结果,确定所述基因的甲基化情况。
2.一种DNA甲基化检测试剂盒,其中所述试剂盒包含:甲基化敏感性限制性内切酶和用于DNA扩增的试剂。
3.甲基化敏感性限制性内切酶在制备DNA甲基化检测试剂盒中的用途,其中所述试剂盒包含用于DNA扩增的试剂。
4.根据权利要求2或3所述的试剂盒或用途,其中所述试剂包括用于对待测DNA中含有至少一段所述酶所识别序列的序列进行扩增和/或检测的试剂,例如扩增引物和/或检测探针。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的方法、试剂盒或用途,其中所述酶特异性地切割未甲基化序列或切割甲基化序列。
6.根据权利要求1-5中任一项所述的方法、试剂盒或用途,其中所述酶特异性地切割未甲基化序列,所述酶优选为选自在酶识别序列中含有CpG的甲基化敏感性限制性内切酶,更优选为选自BstUI酶、HpaII酶和HhaI酶的一种或更多种酶。
7.根据权利要求1-5中任一项所述的方法、试剂盒或用途,其中所述酶特异性地切割甲基化序列,所述酶优选为选自在酶识别序列中含有CpG的甲基化特异性限制性内切酶,更优选为McrBC。
8.根据权利要求4-7中任一项所述的方法、试剂盒或用途,其中所使用的上游和/或下游扩增引物和/或检测探针含有所述酶所识别的序列。
9.根据权利要求1-8中任一项所述的方法、试剂盒或用途,所述方法或试剂盒用于癌症的诊断和/或预后;所述癌症优选为选自胃癌、结直肠癌、乳腺癌、肝癌、肺癌、宫颈癌和头颈癌中的一种或更多种癌,更优选为胃癌。
10.根据权利要求1-9中任一项所述的方法、试剂盒或用途,其中所述待测DNA为RNF180基因,优选扩增RNF180基因中包含选自SEQ ID NO:1-3的序列、或扩增选自SEQ ID NO:1-3的序列。
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