[发明专利]与谷子叶夹角基因紧密连锁的分子标记SIsv0523

说明书

本发明涉及分子生物学领域，具体涉及一种与谷子叶夹角基因紧密连锁的分子标记。所提供的分子标记含有SEQ ID NO:1所示序列。还提供了一种扩增与谷子叶夹角基因紧密连锁的分子标记的引物，包括SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3所示序列。所提供的分子标记和引物可以用于谷子叶夹角基因定位以及谷子的辅助育种领域，可以做到谷子的早甄别和早诊断。

技术领域

本发明涉及分子生物学领域，具体涉及一种与谷子叶夹角基因紧密连锁的分子标记。还涉及扩增该分子标记的引物，该分子标记和引物在谷子叶夹角基因定位或谷子遗传育种中的用途。

背景技术

谷子是起源于我国的重要粮食作物，也是特色抗旱作物，种子萌发只需要占其重量26％的水分，而高粱、小麦和玉米的种子萌发分别需要其重量的40％、45％和48％的水分，同时谷子对低土壤肥力的忍耐力较高。谷子是环境友好型C4作物，也是二倍体自花授粉作物，基因组约470M，非常适合作为基因组研究对象。

许多作物如小麦、水稻和玉米等作物通过培育理想株型新品种使其抗倒性、光能利用效率和产量水平得到显著提高。目前生产上应用的谷子品种大多是披散株型，对光照资源利用率低的品种，对光能利用效率不到1％。但谷子是C4植物，具有超高产的遗传生理。因此，培育具有理想株型的高光效谷子新品种对提高谷子单产水平具有重要意义。以作物叶片的着生角度及其在植株上的垂直分布为表征的叶群结构是决定作物株形的主要因素。它对群体内部的光分布和光合生产起重要作用。

叶夹角是高产和稳产的重要农艺性状，直接关系到谷子光能利用效率和抗倒性。针对谷子叶夹角分子标记及相关研究还需要进一步改进。

发明内容

谷子叶夹角作为高产和稳产的重要农艺性状，直接关系到谷子光能利用效率和抗倒。在谷子抽穗时，植株倒三叶叶片叶夹角小于25度，挺拔上冲，中下部叶片随叶位的降低适当增大与茎的夹角，属于叶夹角紧凑株型，从而使各叶层的入射光分布均匀，减少遮蔽，可以最大限度地利用光能。在谷子抽穗时，植株倒三叶叶片叶夹角大于25度为叶夹角非紧凑株型。借助分子生物学的手段，辨别紧凑型叶夹角以及非紧凑型叶夹角，应用于谷子作物的育种中，可以做到早甄别，早诊断。本发明的发明人通过研究发现与谷子叶夹角紧凑型基因紧密连锁的分子标记SIsv0523，借助该分子标记运用谷子全基因组分子辅助育种技术培育具有理想株型的谷子高产新品种。

在本发明的第一方面，本发明提供了一种与谷子叶夹角基因紧密连锁的分子标记，所述分子标记含有SEQ ID NO:1所示序列，优选地，所述分子标记为SEQ ID NO:1所示序列。SEQ ID NO:1序列如下所示：

TATCATTGGCACAAGGGACTAGTGCAATTATGTTATGATCCAAGGATAAATAGTTCTTCAATCTTTTTTGTCTGCTTCCTCTCCATCTGGATTGCCTAATCTTTTAGGATTCCAGATGGAATCATTAAGGTTCCTTTAACATTCCTTTAGGCCTCGTTCGTTTCACCAGGATTGGATTCCAGCTAGGATTACTTCCAGGTTCGGTTTGAGTGATTCCACCCGTATCACTCAATCCGGTCAGGATTCATTCCAAGGGTGAGGAGGTATGGTTTCAATCCGGGCCATCTAATGTAGAAGGATTCCAATCCAGGCCGGTTTTCGTTCCAGGCCAGACTAAAACGAACAACACTTTCAATGCAAGTCTGGTTTCAAATCGGGTCACTTCAAACCATCCGGAATGGACCTCATTCCGGGCCAATCCGGTGAAAACGAACGAGGTCTTAACAGGGTCTTGGTTGTGTTTCGTTTCTGTCCAACTTTTGTGTTTTCCGGATGACCTTAAATTGGTCTGAATCTGGCAACTCGGGTTGAATCGCTGCAAGTGCTCGCATCGTTGGGGCACTCAGTCTGGTGTCTAGATTCCAGGAGTGCGTAGATTGTTGCTGC(SEQ ID NO:1)。