[发明专利]绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性检测用引物对、试剂盒、方法和应用

说明书

本发明涉及一种利用如上所述的引物对的绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性的检测方法，步骤如下：以待测绵羊基因组DNA为模板，以引物对为扩增引物，利用PCR扩增包含绵羊BMPR1B基因内含子区插入/缺失多态性位点的片段，对扩增产物进行电泳，根据电泳结果鉴定所述插入/缺失多态性位点的基因型。本发明方法根据绵羊BMPR1B基因内含子区插入/缺失多态性位点(参考序列NC_040257.1:g29373339_29373348)设计引物，以绵羊基因组DNA为模板，通过序列扩增、电泳鉴定，能够简单、快速、低成本、精确地检测所述插入/缺失多态性位点的基因型。

技术领域

本发明属于生物技术与家畜育种技术领域，尤其是一种绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性检测用引物对、试剂盒、方法和应用。

背景技术

绵羊以其羊肉肉质鲜美、低脂肪、低胆固醇等特点深受消费者的喜爱，随着人们生活水平的提高，社会对羊肉、羊奶、羊绒等产品的需求越来越高。为了实现高产、优质和高效的绵羊育种目标，人们对绵羊的研究已在分子水平上，以DNA的多态性为标记对绵羊进行基因结构和功能的遗传分析和研究，通过筛查与绵羊产羔数性状密切相关的DNA标记位点并进行检测，并根据其基因多态性与产羔数性状的关联，从而可以加快建立优良产羔数性状绵羊种群，这类标记具有存在较为普遍、遗传稳定、准确度高等优点，因而被广泛应用于各个领域。

分子标记辅助选择(MAS)作为分子遗传标记的常用方法，通过对目标基因所连锁的分子标记的基因型分析从而进行育种，使用这种方法可以大幅度地缩短育种年限，针对某一性状专一选择，从而能够有效地提高育种效率。

近年来，随着测序技术的不断升级与测序成本的降低，插入/缺失(indel)突变作为一种重要的分子遗传标记而逐渐受到人们的重视。插入和缺失(InDels)构成自然突变库的重要组成部分，InDels是由于聚合酶滑移、转座子、不均等交叉等导致的在整个基因组中大量分布的结构，有时可能导致生物体功能的获得或丧失。InDels最常见的类别包括单碱基对插入和缺失，单体碱基对扩展和多碱基对扩展，然而在基因组中包含随机序列和转座子插入的InDel相对较少。由于可以简单地使用凝胶对InDels进行基因分型鉴定，使InDels更具价值。在以前的一些研究中，还发现InDels比微卫星标记更具多态性。如今，InDels已在多种应用中使用，包括种群遗传学，分类学诊断标记，遗传图谱构建和不同农作物中的关联图谱，在动物繁殖性状的选育方面的indel标记的研究和应用较少。在绵羊上已有的部分关于indels的报道显示：在生长方面，有报道在小尾寒羊SIRT7基因3’UTR存在一个17bp的indel可以显著地影响绵羊的胸深等生长性状(Xu et al.,2019)；还有Erdenee等对绵羊ZNF395基因内含子3的一个indel位点进行了关联分析，发现ZNF395基因的该位点对小尾寒羊的胸宽和胸围有极显著影响，对湖羊的管围有极显著影响(Erdenee et al.,2019)。这些研究都表明InDels对动物分子育种具有重要的意义和参考价值。但是，目前InDels在绵羊繁殖育种上的研究较少。