[发明专利]用于鉴别新陆中系列棉花品种的多态性分子标记及其应用

说明书

本发明涉及一种用于鉴别新陆中系列棉花品种的多态性分子标记及其应用，属于分子检测技术领域，该发明利用筛选的29对多态性鉴别引物，实现了80种新陆中系列棉花品种的指纹图谱构建和分子鉴定，该29对引物具有多态性高、稳定性好、操作简单、准确性高、通用性好等优点；本发明仅需19对核心引物即可鉴别80种新陆中系列棉花品种。

技术领域

本发明属于分子检测技术领域，尤其涉及一种用于鉴别新陆中系列棉花品种的多态性分子标记及应用。

背景技术

棉花是富含纤维的重要经济作物，新疆是我国棉花的主要产区，以50％左右的种植面积贡献了近3/4的产量，在保障我国棉花生产安全中占有举足轻重的地位。近年来，随着棉花产业的快速发展，棉花种子市场“多、乱、混、杂”的现象日益严重，棉花品种同质化、品种套牌等问题突出，严重影响棉花产业的健康发展。此外，骨干亲本的反复利用及转基因技术在棉花育种中的应用导致品种间遗传差异越来越小，仅依据传统形态学手段鉴定品种的纯度和真实性耗时长、成本高、时效性差，且易受环境因素影响，难以满足品种鉴定需求。因此，加强检测技术创新，为种子质量鉴定提供高效技术手段极为必要。

分子标记技术的飞速发展成为品种鉴定和种子纯度真实性检测的新选择，以分子标记技术为基础的DNA指纹图谱，不仅可以鉴别棉花品种的真假，还可以分析棉花种质资源遗传多样性及亲缘关系等。目前关于新疆陆地棉品种指纹图谱的研究大多针对特早熟和早熟棉花品种，早中熟陆地棉品种的指纹图谱构建还有待完善。本发明选用80个新陆中棉花品种材料，利用SSR和InDel分子标记构建其指纹图谱，为今后棉花品种DNA指纹鉴定提供技术支持。

SSR(Simple Sequence Repeats，简单重复序列)标记是指：均匀分布于真核生物基因组中的简单重复序列，由2-6个核苷酸的串联重复片段构成，由于重复单位的重复次数在个体间呈高度变异性并且数量丰富。InDel(Insertion-Deletion，插入缺失)标记是指：两种亲本中在全基因组中存在差异，相对另一个亲本而言，其中一个亲本的基因组中有一定数量的核苷酸插入或缺失，从而根据基因组中插入缺失位点，设计一些扩增这些插入缺失位点的PCR引物。

发明内容

本发明的目的就在于为了解决上述问题，而提供一种用于鉴别新陆中系列棉花品种的多态性分子标记及应用，以构建获得能够鉴别新陆中系列棉花品种的DNA指纹图谱，为新陆中系列棉花品种的分子检测和育种提供新的实用标记和方法。

本发明通过以下技术方案来实现上述目的：

本发明提供了一种鉴别新陆中系列棉花品种的多态性分子标记，所述多态性分子标记为由29对多态性鉴别引物中的一种或多种的组合引物组成，所述29对多态性鉴别引物的序列如下所示：

作为本发明进一步的优化方案，所述新陆中系列棉花品种为新陆中1-12、14-22、25-30、32-50、54-69、71-88号品种，对应的多态性分子标记为多态性标记特征引物或多态性标记组合引物，具体为：

鉴别新陆中1号品种的多态性标记组合引物为W01、HAU2786、NAU1233；

鉴别新陆中2号品种的多态性标记特征引物为DPL0757；

鉴别新陆中3号品种的多态性标记组合引物为HAU0732、W01；

鉴别新陆中4号品种的多态性标记特征引物为NAU1221；NAU1042；NAU1269；

鉴别新陆中5号品种的多态性标记组合引物为HAU0732、W01；HAU0732、JESPR0101；

鉴别新陆中6号品种的多态性标记组合引物为BNL3442、HAU2786；BNL3442、W01；

鉴别新陆中7号品种的多态性标记组合引物为JESPR0101、DPL0542；