[发明专利]一种动态交互的单细胞测序数据质控分析平台及方法

权利要求书

1.一种动态交互的单细胞测序数据质控分析平台，包括：

单细胞测序数据获取模块，用于提供数据获取接口，提供用户上传单细胞测序数据，并获取用户所上传的单细胞测序数据；

细胞过滤条件获取模块，用于接收细胞过滤任务请求，所述细胞过滤任务请求中至少包括用于细胞过滤的细胞过滤条件参数；

细胞过滤模块，用于根据所述细胞过滤任务请求，对所述单细胞测序数据获取模块获得的单细胞测序数据进行过滤，过滤其中的低质量细胞，得到过滤后的细胞群体；

可视化结果展示模块，基于所述细胞过滤模块的细胞过滤条件得到的细胞群体，将质控后的细胞组成进行可视化展示。

2.如权利要求1所述的一种动态交互的单细胞测序数据质控分析平台，其特征在于：所述单细胞测序数据获取模块提供用户上传单细胞测序数据的操作界面，以供用户选择并上传单细胞数据，于用户上传单细胞测序数据后，获取用户所上传的单细胞测序数据。

3.如权利要求1所述的一种动态交互的单细胞测序数据质控分析平台，其特征在于：细胞过滤条件获取模块用于提供细胞过滤条件的参数设置界面以提供用户进行细胞过滤条件参数设置，并于设置完细胞过滤条件参数后，产生包含该细胞过滤条件参数的所述细胞过滤任务请求。

4.如权利要求3所述的一种动态交互的单细胞测序数据质控分析平台，其特征在于：所述细胞过滤条件参数包括但不限于单个细胞鉴定到gene数目、细胞中UMI总数、单细胞中UMI的线粒体基因表达量比例、细胞数目抽取值。

5.如权利要求1所述的一种动态交互的单细胞测序数据质控分析平台，其特征在于：所述可视化结果展示模块基于所述细胞过滤模块根据细胞过滤条件得到的细胞群体，绘制小提琴图以将质控后的细胞组成可视化展示。

6.如权利要求5所述的一种动态交互的单细胞测序数据质控分析平台，其特征在于：所述质控分析平台还包括参数切换单元，用于提供用户对所述小提琴图的坐标参数进行切换，并根据切换后的参数更新小提琴图。

7.如权利要求6所述的一种动态交互的单细胞测序数据质控分析平台，其特征在于：所述参数切换单元提供一键式参数切换界面，通过该一键式参数切换界面可对小提琴图进行参数切换选择。

8.如权利要求7所述的一种动态交互的单细胞测序数据质控分析平台，其特征在于：所述参数切换单元通过所述一键式参数切换界面对小提琴图进行横坐标样本或分组展示的参数选择，对纵坐标进行有效基因、有效转录本、无效细胞展示的参数选择，并根据选择的结果更新小提琴图。

9.一种动态交互的单细胞测序数据质控分析方法，包括如下步骤：

步骤S1，提供数据获取接口，通过所述数据获取接口获取用户所上传的单细胞测序数据；

步骤S2，接收细胞过滤任务请求，所述细胞过滤任务请求中至少包括用于细胞过滤的细胞过滤条件参数；

步骤S3，根据所述细胞过滤任务请求，对步骤S1获得的单细胞测序数据进行过滤，过滤其中的低质量细胞，得到过滤后的细胞群体；

步骤S4，基于步骤S3得到的细胞群体，将质控后的细胞组成进行可视化展示。

10.如权利要求9所述的一种动态交互的单细胞测序数据质控分析方法，其特征在于：所述细胞过滤条件参数包括但不限于单个细胞鉴定到gene数目、细胞中UMI总数、单细胞中UMI的线粒体基因表达量比例、细胞数目抽取值。