[发明专利]用于核酸测序和其他分析测定的混合相流体在审
| 申请号: | 201980080348.7 | 申请日: | 2019-12-02 |
| 公开(公告)号: | CN113166805A | 公开(公告)日: | 2021-07-23 |
| 发明(设计)人: | 阿诺德·奥利芬特;亚历克斯·涅米罗斯基;朱利安·肖恩·阿尔伯尼;迈克尔·约翰·埃里克斯塔德;丽贝卡·麦金利;乍得·弗莱舍;埃里克·比利亚雷亚尔 | 申请(专利权)人: | 欧姆尼欧美公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869 |
| 代理公司: | 深圳市世纪恒程知识产权代理事务所 44287 | 代理人: | 胡海国 |
| 地址: | 美国加利福尼亚州*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 核酸 其他 分析 测定 混合 流体 | ||
1.一种核酸测序方法,包括:
(a)提供一种测序系统,所述测序系统包括:
(i)流动池,所述流动池包含固定在其中的核酸,
(ii)气泡发生器部件,所述气泡发生器部件以预定的速率将气泡输送到液体中;
(b)将一系列流体输送到流动池的内部以执行测序过程的循环,其中,至少一种流体是由气泡发生器部件产生的流体泡沫,所述流体泡沫在液体中包括气泡;以及
(c)重复步骤(b),从而确定核酸的序列。
2.如权利要求1所述的方法,其中,将所述核酸固定在所述流动池内部的表面上。
3.如权利要求2所述的方法,其中,所述核酸存在于固定在所述表面上的核酸阵列中的位点。
4.如权利要求3所述的方法,其中,所述测序过程包括从所述阵列中的其他位点光学分辨所述位点。
5.如权利要求1所述的方法,其中,输送到所述流动池的至少一种流体是包含可逆终止的核苷酸的流体泡沫,其中,输送到所述流动池的至少一种流体是包含解封剂的流体泡沫。
6.如权利要求1所述的方法,其中,输送到所述流动池的至少一种流体是包含荧光标记的核苷酸的流体泡沫。
7.如权利要求1所述的方法,其中,输送到所述流动池的至少一种流体是包含聚合酶的流体泡沫。
8.如权利要求7所述的方法,其中,所述聚合酶与荧光标记的核苷酸和流体泡沫中的核酸形成稳定的三元复合物,以及其中,所述测序过程包括光学检测所述稳定的三元复合物。
9.如权利要求7所述的方法,其中,所述聚合酶将荧光标记的核苷酸共价添加至流体泡沫中的核酸,其中,所述测序过程包括光学检测添加至核酸的荧光标记的核苷酸。
10.如权利要求1所述的方法,其中,所述气泡发生器部件包括位于接合处的滤膜,气体通过所述滤膜被输送到液体,其中,所述滤膜包括其中具有孔图案的疏水材料。
11.如权利要求1所述的方法,其中,输送到所述流动池的至少一种流体基本上没有气泡,其中,所述测序过程包括光学检测基本上没有气泡的流体中的核酸。
12.如权利要求1所述的方法,其中,输送包括将至少一部分流体泡沫输送到流动池中、流出流动池并返回到流动池中。
13.如权利要求1所述的方法,其中,所述流体泡沫的气泡的体积分数至少为所述流体泡沫总体积的25%。
14.如权利要求21所述的方法,其中,所述检测通道中气泡的平均直径最多为流动池内部的直径的95%。
15.如权利要求1所述的方法,其中,所述流动池内部的横截面积在10μm2至100mm2之间。
16.如权利要求1所述的方法,其中,所述流动池内部的体积在1μL至10mL之间。
17.如权利要求1所述的方法,其中,所述流体泡沫中的气泡的平均直径在500nm至500μm之间。
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