[发明专利]用于制备、检测和分析流体样品的自动化系统

说明书

本发明涉及一种用于制备、检测和分析包含生物物种的第一流体样品的自动化系统，所述制备、检测和分析系统包括：‑至少一个流体盒体(2)，其包括至少一个浓缩和裂解流体模块(MF1)和包括并行地布置的多个扩增室的网络(30)的检测流体模块(MF2)；‑仪器，该仪器尤其包括：机械组合，其包括固定到所述框架的至少一根可动杆(100)并包括设置为与所述浓缩和裂解流体模块(MF1)的柔性膜(203)协作的自由端部；光学测量系统(13)，其用于测量穿过所述盒体的检测流体模块(MF2)的一个或更多个扩增室的荧光；控制和处理单元(UC)。

技术领域

本发明涉及一种用于制备、检测和分析样品的自动化系统，所述系统包括完整分析仪器和旨在以可拆除的方式插入分析仪器中的盒体。该制备、检测和分析系统特别适于检测细菌在流体样品中的存在。

背景技术

在工业设施中，例如细菌、真菌、藻类、酵母的微生物组织的生长会具有负面的影响。生物膜的生长可能导致许多损害，包括：腐蚀、堵塞、酸化、影响产品。

因此必须通过在敏感区域实现定期取样，实现跟踪在工业环境中有问题的微生物组织的存在。样品可以以生物膜的形式或以流体(例如来自油箱的采出水)的形式来取样。

在这些流体上实现的微生物组织跟踪和检验分析经常基于培养物。传统地，样品在包含对于所关注的微生物组织的生长最优的养料和物理化学条件的环境中用一系列稀释液接种，并在理想温度下孵育。在生长的情况下，使用pH值指示器或形成有颜色的沉淀物指示存在微生物组织。该方法具有简单、成本不高的优点，并且特别地，它可容易地在工业设施简易检验实验室部署。然而，它具有众多缺陷：

-由于孵育时间造成的长响应时间—实际上，如果孵育时间长，可能会是数天到数周；

-某些微生物组织不能够在实验条件下培养，因此不会被检测到；

-必须有高级教育，以理解无菌和/或厌氧接种技术—由此，在操作员之间可能会有结果变化；

-必须有一定的知识，以解读所获得的结果。

自数年起开发了基于DNA检测的新的分子分析方法。然而，它们要求在分子生物技术方面得到非常高教育的人员，尤其是在对于移液和使用微量移液器方面。提取DNA也是该过程的相当长的步骤，意味着在分析之前的裂解、浓缩和纯化的几个步骤。这样的分析因此一般在工业场地之外，在保存样品和向专业实验室运输样品之后实现。

在专利申请US2011/014606A1中以及以下引用的公开中描述了分析解决方案：

Remco Den Dulk:《flowpad,a generic microfluidics platform for a widerange of applications》,11th EPIZONE Annual meeting《Crossing Barriers》19-21,September 2017,21septembre 2017,XP055608282,Paris,France。

Flaender Mélanie et Al:《Grinding lysis(GL):A microfluidic device forsample enrichment and mechanical lysis in one》,Sensors and Actuators:Chemical,Elsevier BV,NL,vol 258,21novembre 2017,pages 148-155,XP085338438,ISSN:0925-4005,DOI:10.1016/J.SNB.2017.11.082。

为了最接近场地并允许增殖期间快速的反应或所使用的抗菌处理的精确优化，因此需要一种制备、检测和分析系统，该系统：

-完全自动化，以限制人工干预；

-允许可靠且快速地确定存在于样品(即使复杂的样品)中的生物物种的性质和数量；