[发明专利]适配体条形码化

权利要求书

1.一种用于样品鉴定的方法，所述方法包括：

使多于一个样品中的每一个分别与多于一种样品索引组合物中的样品索引组合物接触，

其中所述多于一个样品中的每一个包含一个或更多个细胞，每一个细胞包含一种或更多种蛋白靶，其中所述样品索引组合物包含适配体组合物，所述适配体组合物包含适配体和样品索引寡核苷酸，其中所述适配体能够与所述一种或更多种蛋白靶中的至少一种特异性结合，

其中所述样品索引寡核苷酸包含样品索引序列，并且其中所述多于一种样品索引组合物中的至少两种样品索引组合物的样品索引序列包含不同的序列；

使用多于一个条形码将所述样品索引寡核苷酸条形码化，以产生多于一个条形码化样品索引寡核苷酸；

获得所述多于一个条形码化样品索引寡核苷酸的测序数据；并且

基于所述多于一个条形码化样品索引寡核苷酸中的至少一个条形码化样品索引寡核苷酸的样品索引序列鉴定所述一个或更多个细胞中的至少一个细胞的样品来源。

2.一种用于样品鉴定的方法，所述方法包括：

使多于一个样品中的每一个分别与多于一种样品索引组合物中的样品索引组合物接触，

其中所述多于一个样品中的每一个包含一个或更多个细胞，每一个细胞包含一种或更多种细胞组分靶，其中所述样品索引组合物包含适配体组合物，所述适配体组合物包含适配体和样品索引寡核苷酸，其中所述适配体能够与所述一种或更多种细胞组分靶中的至少一种特异性结合，

其中所述样品索引寡核苷酸包含样品索引序列，并且其中所述多于一种样品索引组合物中的至少两种样品索引组合物的样品索引序列包含不同的序列；并且

基于所述多于一种样品索引组合物中的至少一个样品索引寡核苷酸的样品索引序列鉴定所述一个或更多个细胞中的至少一个细胞的样品来源。

3.根据权利要求2所述的方法，其中所述细胞组分靶包括蛋白靶。

4.根据权利要求2-3中任一项所述的方法，其中鉴定所述至少一个细胞的样品来源包括：

使用多于一个条形码将所述多于一种样品索引组合物中的样品索引寡核苷酸条形码化，以产生多于一个条形码化样品索引寡核苷酸；

获得所述多于一个条形码化样品索引寡核苷酸的测序数据；并且

基于所述测序数据中所述多于一个条形码化样品索引寡核苷酸中的至少一个条形码化样品索引寡核苷酸的样品索引序列鉴定所述细胞的样品来源。

5.根据权利要求1-4中任一项所述的方法，其中鉴定所述至少一个细胞的样品来源包括鉴定所述多于一种样品索引组合物中的至少一个样品索引寡核苷酸的样品索引序列的存在或不存在。

6.根据权利要求5所述的方法，其中鉴定所述样品索引序列的存在或不存在包括：

复制所述至少一个样品索引寡核苷酸，以产生多于一个复制的样品索引寡核苷酸；

获得所述多于一个复制的样品索引寡核苷酸的测序数据；并且

基于所述测序数据中对应于所述至少一个条形码化样品索引寡核苷酸的所述多于一个样品索引寡核苷酸的复制的样品索引寡核苷酸的样品索引序列鉴定所述细胞的样品来源。

7.根据权利要求6所述的方法，

其中复制所述至少一个样品索引寡核苷酸以产生所述多于一个复制的样品索引寡核苷酸包括：在复制所述至少一个条形码化样品索引寡核苷酸之前，将复制衔接子连接至所述至少一个条形码化样品索引寡核苷酸，并且

其中复制所述至少一个条形码化样品索引寡核苷酸包括使用连接至所述至少一个条形码化样品索引寡核苷酸的复制衔接子复制所述至少一个条形码化样品索引寡核苷酸，以产生所述多于一个复制的样品索引寡核苷酸。