[发明专利]核酸分离的方法和组合物

说明书

提供了用于从生物样品分离核酸的方法和组合物。

相关申请的交叉引用

本申请要求于2018年8月17日提交的美国临时申请第62/765,013号的权益，其全部内容通过引用并入本文。

关于序列表的声明

与本申请相关联的序列表以文本格式代替纸质副本提供，并且通过引用并入本说明书中。包含序列表的文本文件的名称为70132_Seq_Final_2019-08-14.txt。文本文件为3.0KB；创建于2019年8月14日；并在提交说明书时通过EFS-Web提交。

发明领域

本发明涉及从包含核酸的样品中分离核酸的方法和组合物。

背景

与传统的诊断方法相比，通过各种自动化分析技术，例如聚合酶链式反应(PCR)，利用核酸扩增和/或检测的分子诊断分析可以在更短的时间内提供快速而准确的结果，并且可以轻松实现自动化。然而，为了对生物样品进行分子诊断分析，必须从生物材料中分离核酸，以去除可能例如通过抑制聚合酶活性影响分析准确性的组分。即使存在多种用于核酸提取的方法，但是当前可用的方法通常涉及冗长的步骤，并且不易于自动化。因此，在扩增和检测特定靶标之前制备核酸样品是分子诊断学中最具挑战性的步骤。

需要简单且快速的核酸分离方法来制备不含扩增抑制剂的有质量的核酸，所述方法不需要大量样品处理并且可以适应临床实验室自动化。需要能够以与快速、自动化的核酸检测方法兼容的方式促进核酸从包含核酸的生物样品中分离的试剂。

发明概述

一方面，本文提供了用于从包含核酸的样品中分离核酸的方法，包括：

(a)使包含核酸的样品与包含多糖的水性组合物接触，所述多糖包含一个或多个糖醛酸单元；和

(b)在固体载体上浓缩所述核酸，从而分离所述核酸。

在本文公开的方法的一些实施方案中，所述多糖还包含改性的糖醛酸单元，例如糖醛酸酰胺单元、糖醛酸酯单元或其组合。

在一些实施方案中，多糖还包含一个或多个由式II表示的单元，其异构体、盐、互变异构体或组合：

其中：

R²和R³独立地为H、任选取代的C1-C8烷基、任选取代的C3-C8环烷基、任选取代的C3-C8杂环烷基或任选取代的C2-C20杂烷基。

在一些实施方案中，所述多糖还包含一个或多个式(III)的单元，其异构体、盐、互变异构体或组合：

其中R³为CH₂CH₂NH₂、CH₂CH₂N(CH₃)₂、CH₂CH₂OH、NH₂、H、CH₃、CH₂CH₂OCH₂CH₂NH₂或CH₂CH₂NHCH₂CH₂NH₂。

在一些实施方案中，所述多糖包含一个或多个具有式VI的结构的单体单元，其异构体、盐、互变异构体或组合：