[发明专利]靶向RNA的融合蛋白组合物和使用方法

权利要求书

1.一种组合物，所述组合物包含编码RNA指导的靶RNA结合融合蛋白的核酸序列，所述融合蛋白包含(a)第一RNA结合多肽或其部分；以及(b)第二RNA结合多肽，其中在通过gRNA序列指导时，所述第一RNA结合多肽结合靶RNA，并且其中所述第二RNA结合多肽包含RNA-核酸酶活性。

2.根据权利要求1所述的组合物，其中所述第一RNA结合多肽或其部分是CRISPR/Cas多肽或其部分。

3.根据权利要求2所述的组合物，其中所述CRISPR/Cas多肽或其部分选自Cas9、Cpf1、Cas13a、Cas13b、Cas13c和CasRX/Cas13d，其中所述CRISPR/Cas多肽具有天然的、降低的或无效的活性。

4.根据权利要求1所述的组合物，其中所述第二RNA结合多肽以与RNA缔合的方式结合RNA。

5.根据权利要求4所述的组合物，其中所述第二RNA结合多肽以切割RNA的方式与RNA缔合。

6.根据权利要求1所述的组合物，其中所述核酸序列包含启动子。

7.根据权利要求6所述的组合物，其中所述启动子是组成型启动子或组织特异性启动子。

8.根据权利要求1所述的组合物，其中所述核酸序列还包含gRNA序列，其中所述gRNA序列包含特异性结合RNA分子内的靶序列的间隔子序列和与所述第一RNA结合多肽特异性结合的支架序列。

9.根据权利要求8所述的组合物，其中所述间隔子序列包含含有选自以下的序列的至少1、2、3、4、5、6或7个重复的序列：CUG(SEQ ID NO:18)、CCUG(SEQ ID NO:19)、CAG(SEQ IDNO:80)、GGGGCC(SEQ ID NO:81)及其组合。

10.根据权利要求8所述的组合物，其中所述核酸序列包含驱动所述gRNA序列的表达的启动子。

11.根据权利要求9所述的组合物，其中所述启动子是聚合酶III启动子。

12.根据权利要求10所述的组合物，其中所述聚合酶III启动子是U6启动子。

13.根据权利要求1或9所述的组合物，其中所述启动子是tRNA启动子。

14.根据权利要求1或9所述的组合物，其中所述融合蛋白包含NLS、NES或标签。

15.一种载体，其包含根据权利要求1或8所述的组合物。

16.根据权利要求15所述的载体，其中所述载体选自：腺相关病毒、逆转录病毒、慢病毒、腺病毒、纳米颗粒、胶束、脂质体、阳离子脂质体/DNA复合物、聚合物囊泡、聚合物/DNA复合物和树枝状聚合物。

17.一种细胞，其包含根据权利要求15所述的载体。