[发明专利]用于产生T细胞受体肽文库的自动化仪器

权利要求书

1.一种使用仪器产生表达工程化肽的细胞文库的自动化方法，所述方法包括：

提供细胞群体；

使用用于多重化的核酸酶指导的基因组编辑的仪器，使用引入的核酸和核酸指导的核酸酶处理所述细胞群体，以产生包含编码被配置为在细胞的表面上展示的工程化肽的核酸的细胞；

孵育处理的细胞以促进所述细胞中的核酸编辑，其中所述编辑在所述细胞中提供编码工程化肽抗原的核酸；和

允许所述细胞在所述细胞的表面上表达和展示所述工程化肽。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述工程化肽是推定的TCR结合抗原。

3.根据权利要求1-2所述的方法，其中所述工程化肽包括预测的TCR结合区。

4.根据权利要求1-3所述的方法，其中所述细胞群体是酵母细胞。

5.根据权利要求1-4所述的方法，其中所述核酸酶是RNA指导的核酸酶。

6.一种产生在细胞的表面上表达工程化的推定的T细胞受体(TCR)抗原的细胞文库的自动化方法，所述方法包括：

提供细胞群体；

使用用于多重化的核酸酶指导的基因组编辑的仪器、使用引入的核酸和核酸酶处理所述细胞群体，以产生包含编码被配置为在所述细胞的表面上展示的工程化肽抗原的核酸的细胞；

孵育处理的细胞以促进所述细胞中的核酸编辑，其中所述编辑在所述细胞中提供编码工程化肽抗原的核酸；和

允许所述细胞在所述细胞的表面上表达和展示是推定的TCR抗原的所述工程化肽抗原。

7.根据权利要求6所述的方法，其中所述细胞群体是酵母细胞。

8.根据权利要求6所述的方法，其中所述细胞群体是哺乳动物细胞。

9.根据权利要求6-8所述的方法，其中所述细胞展示所述工程化肽抗原作为配体的一部分。

10.根据权利要求6-8所述的方法，其中所述细胞共表达推定的TCR抗原和MHC分子。

11.根据权利要求6-10所述的方法，其中所述核酸酶是核酸指导的核酸酶。

12.根据权利要求11所述的方法，其中所述核酸酶是RNA指导的核酸酶。

13.根据权利要求6-12所述的方法，其中所述工程化肽抗原中的一种或更多种是一种或更多种孤儿TCR的推定抗原。

14.根据权利要求6-12所述的方法，其中所述工程化肽抗原中的一种或更多种是一种或更多种TCR的已知抗原。

15.一种用于鉴定与一种或更多种T细胞受体(TCR)选择性结合的肽的自动化多重化方法，所述方法包括：

提供细胞群体；

使用用于多重化的核酸酶指导的基因组编辑的自动化系统并将编码工程化肽抗原和核酸酶的核酸引入所述细胞群体来处理所述细胞群体；

孵育所述细胞以促进所述细胞中的核酸编辑；和

允许编辑的细胞在所述编辑的细胞的表面上表达和展示所述工程化肽抗原；

针对一种或更多种TCR筛选展示所述工程化肽抗原的所述编辑的细胞；和

鉴定表达与一个或更多个TCR选择性结合的工程化肽抗原的编辑的细胞。

16.根据权利要求15所述的方法，所述方法还包括从所述细胞中分离编码与一种或更多种TCR选择性结合的所述工程化肽抗原的核酸。

17.根据权利要求15-16所述的方法，其中所述核酸酶是核酸指导的核酸酶。