[发明专利]用于核酸检测和定量的产品和方法在审
申请号: | 201980037046.1 | 申请日: | 2019-05-31 |
公开(公告)号: | CN112292459A | 公开(公告)日: | 2021-01-29 |
发明(设计)人: | M·莫斯可 | 申请(专利权)人: | 基纳生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6827 | 分类号: | C12Q1/6827 |
代理公司: | 上海专利商标事务所有限公司 31100 | 代理人: | 李政璋;陶家蓉 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 核酸 检测 定量 产品 方法 | ||
1.一种用于检测一种或多种靶核酸存在、不存在或量的方法,其包括:
(a)将所述一种或多种靶核酸各自与寡核苷酸杂交,所述寡核苷酸包含对应靶核酸的部分的区域,由此生成杂交的寡核苷酸;
(b)使所述杂交的寡核苷酸与延伸组合物在延伸条件下接触,从而生成延伸的寡核苷酸,所述延伸组合物包含一种或多种链终止试剂;
(c)使(b)的产物与具有3'-5'外切核酸酶活性的酶接触,从而使未延伸的寡核苷酸被消化,而包含链终止试剂的延伸的寡核苷酸不被消化;和
(d)分析所述延伸的寡核苷酸,从而检测所述一种或多种靶核酸存在、不存在或量。
2.如权利要求1所述的方法,其中,至少一种链终止试剂在纳入(b)中寡核苷酸时阻断所述酶的3'-5'外切核酸酶活性。
3.如权利要求1或2所述的方法,其中,至少一种链终止试剂是链终止核苷酸。
4.如权利要求3所述的方法,其中,所述链终止核苷酸在所述链终止核苷酸的戊糖部分的3'碳处被修饰。
5.如权利要求1-4中任一项所述的方法,其中,至少一种链终止试剂是双脱氧核苷。
6.如权利要求5所述的方法,其中,所述双脱氧核苷酸选自:ddATP、ddGTP、ddCTP、ddTTP和ddUTP。
7.如权利要求3所述的方法,其中,所述链终止试剂是无环核苷酸。
8.如权利要求7所述的方法,其中,所述无环核苷酸选自:acyATP、acyCTP、acyGTP、acyTTP和acy-溴-UTP。
9.如权利要求1-8中任一项所述的方法,其中,多种靶核酸在单一多重化反应中检测。
10.如权利要求1-9中任一项所述的方法,其中,所述酶对单链DNA具有特异性。
11.如权利要求1-10中任一项所述的方法,其中,所述酶的3'-5'外切核酸酶活性被双脱氧核苷酸或无环核苷酸抑制。
12.如权利要求11所述的方法,其中,所述酶来自嗜热栖热菌(Thermusthermophilus)。
13.如权利要求12所述的方法,其中,所述酶是TTHB178。
14.如权利要求1-13中任一项所述的方法,其中,所述延伸的寡核苷酸包含可检测标记物。
15.如权利要求1-14中任一项所述的方法,其中,至少一种链终止试剂是链终止核苷酸,并且所述终止核苷酸包含可检测标记物。
16.如权利要求14或15所述的方法,其中,所述可检测标记物是荧光标记物或染料。
17.如权利要求16所述的方法,其中,所述荧光标记物或染料通过电泳或实时PCR检测。
18.如权利要求14-17中任一项所述的方法,其中,所述可检测标记物是质量标记物。
19.如权利要求18所述的方法,其中,所述质量标记物是质量可区分标签,其位于对应所述靶核酸的部分的所述寡核苷酸的区域的5'处,或所述链终止试剂包含所述质量可区分标签。
20.如权利要求18或19所述的方法,其中,所述质量标记物的检测通过质谱进行。
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