[发明专利]用于急性移植物抗宿主病的供体选择和预后的组合物和方法

说明书

提供了用于急性移植物抗宿主病的供体选择和预后的组合物和方法。提供了方法，其包括从处于GVHD风险的第一受试者获得第一生物学样品，检测所述样品中的miR‑142‑3p水平；和确定所述第一受试者中GVHD的风险、预后或诊断。还提供了选择干细胞移植供体的方法，其包括从第一受试者获得第一生物学样品和从第二受试者获得第二生物学样品，检测所述第一生物学样品和第二生物学样品中的miR‑142‑3p水平；确定第二生物学样品中的miR‑142‑3p水平与第一生物学样品中的miR‑142‑3p水平的比率；基于所述比率确定第一受试者将发展GVHD的可能性；和基于所述比率选择移植供体。

交叉引用的申请

本申请要求于2018年4月19日提交的美国临时申请号62/659,807的权益，其全部内容通过引用并入本文。

序列表

本申请包含已通过EFS-Web以ASCII格式提交并其全部内容通过引用并入本文的序列表。所述ASCII副本，创建于2019年4月19日，名为DU6176PCT_Seq_Listing_ST25.txt并且大小为2,186字节。

关于联邦资助研究的声明

本发明是在NIH/NIAID授予的联邦资助号AI119707的政府支持下完成的。联邦政府对本发明享有某些权利。

技术领域

提供了用于受试者中急性移植物抗宿主病的供体选择、诊断、预后和确定风险的组合物和方法。

发明背景

同种异体骨髓干细胞移植(BMT)是一种用于治疗白血病以及其他非恶性疾病的有效治疗性方法。但是，植入的T细胞可能攻击受体中的许多器官，从而在BMT后100天内诱发急性移植物抗宿主病(aGVHD)。目前，人白细胞抗原(HLA)是用于骨髓或脐带血移植的供体与受体匹配的主要考虑因素。供体和受体之间紧密的HLA匹配降低了受体将发展aGVHD的机会。但是，还需要其他生物学标志物来确定与GVHD的发展有关的风险。

发明概述

本公开内容部分上提供了用于受试者中急性移植物抗宿主病的供体选择和预后的组合物和方法。

提供了如下方法，其中包括(a)从处于GVHD风险的第一受试者获得第一生物学样品，和(b)检测所述样品中的miR-142-3p水平。在一些方面，该样品与不处于GVHD风险的第二受试者获得的第二生物学样品相比具有降低水平的miR-142-3p。在一些方面，第一受试者需要骨髓干细胞移植。一些方面包括将从第一受试者获得的样品中的miR-142-3p水平与从第二受试者获得的miR-142-3p水平进行比较。一些方面包括确定第一受试者中GVHD的风险、预后或诊断。一些方面包括对第一受试者执行干细胞移植。

还提供了用于选择干细胞移植供体的方法，包括：(a)从第一受试者获得第一生物学样品和从第二受试者获得第二生物学样品，(b)检测第一生物学样品和第二生物学样品中的miR-142-3p水平；(c)确定(i)第二生物学样品中的miR-142-3p水平与(ii)第一生物学样品中的miR-142-3p水平的比率；和(d)基于所述比率确定第一受试者将发展GVHD的可能性。一些方面包括基于该比率选择移植供体。

一些方面包括基于所述比率不选择移植供体。一些方面包括：如果(i)∶(ii)的比率是至少约2∶1，则将来自第二受试者的干细胞移植到第一受试者。在一些方面，所述比率是约2.5∶1、约3∶1、约3.5∶1、约4∶1、约4.5∶1或约5∶1。

在一些方面，所述方法包括从一个或多个另外的受试者获得一个或多个另外的生物学样品，其中(i)第二生物学样品中的miR-142-3p水平与(ii)第一生物学样品中的miR-142-3p水平的比率高于(i)所述一个或多个另外的生物学样品中的miR-142-3p水平与(ii)第一生物学样品中的miR-142-3p水平的比率；和将来自第二受试者的干细胞移植到第一受试者。