[发明专利]用于分析核酸的方法和组合物

权利要求书

1.一种用于产生核酸文库的方法，其包括：

将包含靶核酸的核酸组合物与多个寡核苷酸种类组合，其中：

a)所述靶核酸的一些或全部包含突出端；

b)所述多个寡核苷酸种类中的一些或全部寡核苷酸包含两条链，以及第一末端处的突出端和第二末端处的两条非互补链；其中所述突出端能够与靶核酸突出端杂交，其中每个寡核苷酸种类都具有唯一的突出端序列和长度；

c)所述多个寡核苷酸种类中的每种寡核苷酸都包含对于所述寡核苷酸突出端的一个或多个特征具有特异性的寡核苷酸突出端识别序列；并且

d)在寡核苷酸突出端与具有相应长度的靶核酸突出端杂交的条件下，将所述核酸组合物和所述多个寡核苷酸种类组合，由此形成杂交产物。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述多个寡核苷酸种类包括具有5'突出端的寡核苷酸和具有3'突出端的寡核苷酸。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其中所述多个寡核苷酸种类包括具有5'突出端的寡核苷酸、具有3'突出端的寡核苷酸和不具有突出端的寡核苷酸。

4.根据权利要求1到3中任一项所述的方法，其中包含突出端的寡核苷酸包含第一末端处的突出端、双链体部分和第二末端处的两条非互补链。

5.根据权利要求1到4中任一项所述的方法，其中所述寡核苷酸突出端包含1个、2个、3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个、10个、11个、12个、13个、14个、15个、16个、17个、18个、19个或20个核苷酸。

6.根据权利要求1到5中任一项所述的方法，其中所述多个寡核苷酸种类中的所述寡核苷酸包含针对特定突出端长度具有不同序列的寡核苷酸突出端。

7.根据权利要求6所述的方法，其中所述多个寡核苷酸种类中的所述寡核苷酸包含针对特定突出端长度的所有可能的突出端序列组合。

8.根据权利要求7所述的方法，其中所述多个寡核苷酸种类中的所述寡核苷酸包含针对每个突出端长度的所有可能的突出端序列组合。

9.根据权利要求6、7或8的方法，其中所述寡核苷酸突出端序列是随机的。

10.根据权利要求1到9中任一项所述的方法，其中不包含突出端的寡核苷酸包含平端第一末端、双链体部分和第二末端处的两条非互补链。

11.根据权利要求1到10中任一项所述的方法，其中寡核苷酸的末端能够共价连接到所述寡核苷酸在所述杂交产物中所杂交的靶核酸的末端。

12.根据权利要求11所述的方法，其中寡核苷酸链的3'末端能够共价连接到所述寡核苷酸在所述杂交产物中所杂交的所述靶核酸中的链的5'末端。

13.根据权利要求1到12中任一项所述的方法，其中所述杂交产物包含双链体区和至少一个包含两条非互补链的末端。

14.根据权利要求1到13中任一项所述的方法，其中所述杂交产物包含双链体区和每个末端处的两条非互补链。

15.根据权利要求1到14中任一项所述的方法，其中所述寡核苷酸突出端识别序列特异于所述寡核苷酸突出端的长度。

16.根据权利要求1到15中任一项所述的方法，其中所述寡核苷酸突出端识别序列特异于所述寡核苷酸突出端的长度并且对于所述寡核苷酸突出端的一个或多个特征具有特异性，所述一个或多个特征选自(i)5'突出端、(ii)3'突出端、(iii)特定序列、(iv)(i)和(iii)的组合、或(v)(ii)和(iii)的组合。