[发明专利]一种鉴别水稻GS5基因和GLW7基因类型的引物及其应用在审
申请号: | 201911402905.0 | 申请日: | 2019-12-31 |
公开(公告)号: | CN110894542A | 公开(公告)日: | 2020-03-20 |
发明(设计)人: | 张林;谢东;刘巧泉;卞中;邹怡婷;范晓磊;李钱峰;张昌泉 | 申请(专利权)人: | 扬州大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 | 代理人: | 柏尚春 |
地址: | 225009 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴别 水稻 gs5 基因 glw7 类型 引物 及其 应用 | ||
1.一种鉴别GS5基因和GLW7基因类型的引物,其特征在于,包括如下引物:
(1)鉴别GS5基因类型的引物:其核苷酸序列如SEQ ID NO.:1~2所示;
(2)鉴别GLW7基因类型的引物:其核苷酸序列如SEQ ID NO.:3~4或SEQ ID NO.:5~6所示。
2.一种鉴别GS5基因或GLW7基因类型的试剂,其特征在于,包括SEQ ID NO.:1~6任一所示引物。
3.一种鉴别GS5基因和GLW7基因类型的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)提取待测水稻的基因组DNA;
(2)以步骤(1)得到的DNA为模板、SEQ ID NO.:1~2或SEQ ID NO.:3~4或SEQ ID NO.:5~6所示序列为引物分别进行PCR扩增;
(3)SEQ ID NO.:1~2所示引物扩增得到的产物用AluI内切酶进行酶切处理,SEQ IDNO.:3~4所示引物扩增得到的产物用HinfI内切酶进行酶切处理;然后将酶切产物与SEQID NO.:5~6所示引物的PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳;
(4)若SEQ ID NO.:1~2所示引物的PCR产物以AluI内切酶酶切后得到片段大小为229bpbp,则该水稻中GS5基因型为AAAC;若AluI内切酶酶切后得到片段大小为262bp,则水稻中GS5基因型为AAACAAAC;
若SEQ ID NO.:3~4所示引物的PCR产物以HinfI内切酶酶切后得到99bp,则该水稻中GLW7基因型为CTTCCACTTCCA,若HinfI内切酶酶切后得到片段大小为133bp,则该水稻中GLW7基因型为CTTCCACTTCCACTTCCA;
若SEQ ID NO.:5~6所示引物的PCR得到的片段大小为98bp则该水稻中GLW7基因型为CTTCCACTTCCA,若得到的片段大小为107bp,则该水稻中GLW7基因型为CTTCCACTTCCACTTCCA。
4.根据权利要求3所述的鉴别GS5基因和GLW7基因类型的方法,其特征在于,所述步骤(2)中,所述PCR扩增的条件如下:94℃变性3分钟,随后进行35个循环的“94℃变性20秒-55℃退火30秒-72℃延伸20秒”,最后72℃延伸5分钟。
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