[发明专利]一种i-motif杂交分子及其制备方法和应用有效
申请号: | 201911393323.0 | 申请日: | 2019-12-30 |
公开(公告)号: | CN111118000B | 公开(公告)日: | 2022-03-01 |
发明(设计)人: | 李涛;史丽丽 | 申请(专利权)人: | 中国科学技术大学 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12N15/10;C07D277/66;C09K11/06;G01N21/64 |
代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人: | 刘猛 |
地址: | 230026 安*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 motif 杂交 分子 及其 制备 方法 应用 | ||
1.一种i-motif杂交分子,其特征在于,在i-motif的5’端或3’端连接有NGGA四碱基组的平行双链,所述平行双链通过四碱基组间的G-G、A-A之间的氢键连接,其中N为碱基A、G、C或T并位于i-motif杂交分子末端。
2.根据权利要求1所述i-motif杂交分子,其特征在于,i-motif由两条结构为CnT3Cn-1、CnT3Cn或Cn-1T3Cn的单链配对形成,3n7,C、T为碱基。
3.权利要求1或2所述i-motif杂交分子在DNA四面体的二聚体组装中或在免标记细胞荧光成像中的应用。
4.权利要求1所述i-motif杂交分子的制备方法,其特征在于,将i-motif的两条单链的5’端或3’端引入NGGA四碱基组,在酸性环境下加热,然后冷却至室温,使i-motif折叠形成双分子i-motif四链螺旋结构,使其两个NGGA部位彼此靠近,通过氢键作用,形成一段很短的平行双链结构,获得所述i-motif杂交分子。
5.根据权利要求4所述制备方法,其特征在于,所述在酸性环境下加热为在pH 5的TAE缓冲中于90℃下加热。
6.一种DNA四面体结构的二聚体,其特征在于,包含两个DNA四面体和权利要求1或2所述的i-motif杂交分子,所述i-motif杂交分子的两条链分别与两个DNA四面体的一个顶点连接;两个DNA四面体的其余顶点连接可将DNA四面体纳米结构固定在细胞表面的物质。
7.权利要求6所述二聚体在免标记细胞荧光成像中的应用。
8.权利要求6所述DNA四面体结构的二聚体的制备方法,其特征在于,将权利要求1或2所述的i-motif杂交分子的两条链,分别与第一DNA四面体四条链中的一条链和第二DNA四面体四条链中的一条链连接,然后将第一DNA四面体四条链和第二DNA四面体四条链分别自组装形成为四面体结构;混合两个四面体结构,在酸性环境下和37度下作用,通过形成i-motif杂交结构形成DNA四面体结构的二聚体。
9.一种免标记细胞荧光成像方法,其特征在于,将权利要求6所述二聚体与酸性生理微环境中的靶细胞在细胞培养液中孵育,加入硫黄素或其衍生物继续作用,然后在共聚焦荧光显微镜下进行成像定位。
10.一种免标记细胞荧光成像方法,其特征在于,将权利要求6所述二聚体与靶细胞在细胞培养液中孵育,加入硫黄素或其衍生物继续作用,然后在共聚焦荧光显微镜下进行成像,调节细胞培养液的pH,重复以上荧光成像实验,利用软件对靶细胞膜表面的荧光强度进行定量,绘制标准曲线;利用未调节pH的二聚体与靶细胞的细胞培养液,重复以上荧光成像实验,根据靶细胞膜荧光强度,结合标准曲线,测得靶细胞膜表面pH值。
11.根据权利要求9或10所述方法,其特征在于,所述硫黄素衍生物具有式1所示结构:
其中,R1为-H或-CH3或-CN;R2为-CH3或-CH2CN;R3为吡咯烷基或-N(CH3)2。
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