[发明专利]转GhSOCL1基因棉花插入位点的侧翼序列及其特异性鉴定方法在审

专利信息
申请号: 201911373956.5 申请日: 2019-12-27
公开(公告)号: CN113046457A 公开(公告)日: 2021-06-29
发明(设计)人: 马启峰;范术丽;张晓红;乔凯凯;张朝军;于霁雯;喻树迅 申请(专利权)人: 中国农业科学院棉花研究所
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 北京化育知识产权代理有限公司 11833 代理人: 尹均利
地址: 455000 河*** 国省代码: 河南;41
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摘要:
搜索关键词: ghsocl1 基因 棉花 插入 侧翼 序列 及其 特异性 鉴定 方法
【权利要求书】:

1.转GhSOCL1基因棉花插入位点的侧翼序列,其特征在于,包括左侧翼序列和/或右侧翼序列;所述左侧翼序列的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:2所示,所述右侧翼序列的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:3所示;所述左侧翼序列的第1~912位点序列来源于中棉所24的基因组序列,所述左侧翼序列的第913~1348位点序列来源于转GhSOCL1基因棉花的外源插入片段序列;所述右侧翼序列的第1~466位点序列来源于转GhSOCL1基因棉花的外源插入片段序列,所述右侧翼序列的第467~1269位点序列来源于中棉所24的基因组序列。

2.转GhSOCL1基因棉花插入位点的侧翼序列的特异性鉴定引物,其特征在于,所述的引物是依据如权利要求1所述的侧翼序列进行设计的。

3.根据权利要求2所述的转GhSOCL1基因棉花插入位点的侧翼序列的特异性鉴定引物,其特征在于,所述的引物包括第一引物和/或第二引物;所述第一引物包括依据左侧翼序列的第1~912位点序列进行设计的第一正向引物以及依据左侧翼序列的第913~1348位点序列进行设计的第一反向引物;所述第二引物包括依据右侧翼序列的第1~466位点序列进行设计的第二正向引物以及依据右侧翼序列的第467~1269位点序列进行设计的第二反向引物。

4.根据权利要求3所述的转GhSOCL1基因棉花插入位点的侧翼序列的特异性鉴定引物,其特征在于,所述的第一正向引物的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:4所示;所述的第一反向引物的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:5所示。

5.根据权利要求3所述的转GhSOCL1基因棉花插入位点的侧翼序列的特异性鉴定引物,其特征在于,所述的第二正向引物的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:6所示;所述的第二反向引物的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:7所示。

6.转GhSOCL1基因棉花插入位点的侧翼序列的特异性鉴定试剂盒,包括PCR预混液,其特征在于,还包括如权利要求2~5中任一项所述的引物。

7.转GhSOCL1基因棉花插入位点的侧翼序列的特异性鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:

获取待检测样品的基因组DNA,作为DNA模板;

将DNA模板、PCR预混液以及如权利要求2~5中任一项所述的引物进行混合,得到PCR反应液;

将PCR反应液进行PCR扩增反应,得到PCR反应产物;

对PCR反应产物进行凝胶电泳检测,以判断所述PCR反应产物中是否存在特异性条带;若所述PCR反应产物中存在特异性条带,则所述待检测样品中含有转GhSOCL1基因棉花的成分。

8.根据权利要求7所述的转GhSOCL1基因棉花插入位点的侧翼序列的特异性鉴定方法,其特征在于,所述的步骤中,凝胶电泳检测为琼脂糖凝胶电泳检测。

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