[发明专利]一种数字病理切片的云存储方法有效

专利信息
申请号: 201911354310.2 申请日: 2019-12-25
公开(公告)号: CN111222064B 公开(公告)日: 2023-08-01
发明(设计)人: 陈定苗;简刚;唐武斌 申请(专利权)人: 宁波市科技园区明天医网科技有限公司
主分类号: G06F16/957 分类号: G06F16/957;G06F16/51
代理公司: 杭州斯可睿专利事务所有限公司 33241 代理人: 唐迅
地址: 315040 浙江省宁波市高新区创苑路80*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 一种 数字 病理 切片 存储 方法
【说明书】:

发明公开了一种数字病理切片的云存储方法,包括以下步骤:(1)加载数字病理切片,并解析其包含的层数以及每一层的信息;(2)取出第N层,N从0开始,并以当前层的索引号为名称创建文件夹Layer‑N;解析N层的图像块的总行数Rows和总列数Cols;并从第0行第0列开始遍历该图像矩阵,根据行列索引取出该层下的每一个图像;将所在的第i行第j列的图像保存在Layer‑N目录内,并通过将对应的图像命名为i_j.jpg;并判断目前查询的是否到达最后一层,如果不是,则跳转到步骤2;如果是,根据信息生成一个Json索引文件,并且命名为SliceInfo.json,保存在Layer文件夹的同级目录下,将Layer文件夹和Json文件一同上传到云端进行保存。本发明提高后期浏览效率。

技术领域

本发明涉及一种数字病理切片的云存储方法的技术领域,特别是一种数字病理切片的云存储方法。

背景技术

目前医疗影像信息化水平快速发展,尤其是远程医疗、移动医疗的开展,基于数字医疗信息的医疗诊治活动已超出局域网环境下的医院内部范围,扩展到无线网络和广域网应用环境下的医院间、地区间的区域协同医疗范围,数字病理图像显示系统应用平台扩展到基于IOS、Android、Windows Phone等移动操作系统的各种只能移动应用平台。

对象存储是面向对象/文件的、海量的互联网存储,也可以直接被称为“云存储”。它提高了存储效率,通过虚拟化技术解决了存储空间的浪费,可以自动重新分配数据,提高了存储空间的利用率,同时具备负载均衡、故障冗余的功能。

数字病理切片文件一般都比较大,小则几百兆,大则几个G。所以将数字病理切片存储于对象存储中将会是一个以后主流的存储方案。

目前的数字病理切片都是采用分层存储的,即文件中会保存1-N个不同的扫描倍率的图像,而每一个扫描倍率的图像作为一层。每一层的图像都会被拆分成N个256x256大小图片进行存储如图1所示,文件中会记录每一小块图片其扫描倍率,在源图像上的位置等信息。以此组成一个数字病理切片文件。

如果将病理切片文件存储于对象存储上,由于我们无法直接通过对象存储的文件访问接口来直接解析文件,导致我们在浏览数字病理图像时,需要先将整个病理切片文件下载到服务器本地磁盘,再使用操作系统提供的文件访问接口去解析其文件中的内容并返回给前端进行显示,但是每次需要将整个数字病理切片文件下载到本地的操作,会造成客户端很长的等待时间,大大降低了用户使用体验。

发明内容

本发明的目的是为了解决对象存储现有技术的不足而提供一种能够大大提升客户端浏览的速度,且不必下载整个切片文件到本地后再进行解析处理操作的数字病理切片文件的云存储方法。

为了实现上述目的,本发明所设计的一种数字病理切片的云存储方法,具体包括以下步骤:

(1)通过加载数字病理切片,并解析其包含的层数以及每一层的信息;

(2)取出第N层,N从0开始,并以当前层的索引号为名称创建文件夹Layer-N;

(3)然后通过解析步骤2中的文件夹Layer-N对应的N层的图像块的总行数Rows和总列数Cols;

(4)然后在步骤3中,从第0行第0列开始遍历该图像矩阵,根据行列索引取出该层下的每一个图像;

(5)然后将每一个图像按照其所在的第i行第j列的图像保存在Layer-N目录内,并通过将对应的图像命名为i_j.jpg;

(6)并判断目前查询的是否到达最后一层,如果不是,则跳转到步骤2;如果是,则跳转到步骤7;

(7)根据上述各个步骤的信息生成一个Json索引文件,并且命名为SliceInfo.json,然后保存在Layer文件夹的同级目录下;

(8)最终将Layer文件夹和Json文件一同上传到云端进行保存。

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