[发明专利]与肌内脂肪相关的分子标记及其应用

说明书

本发明涉及分子标记技术领域，具体涉及与肌内脂肪相关的分子标记及其应用。本发明利用10×Genomics单细胞RNA测序技术检测不同发育阶段的鸡肌肉细胞和肌内脂肪细胞的转录组，筛选获得肌内脂肪组织特异性表达基因，进一步进行原位表达验证和扩群验证，证明载脂蛋白A1基因可作为肌内脂肪组织的特异性分子标记。载脂蛋白A1可用于鉴定肌内脂肪组织以及评价肌内脂肪含量，具有较高的特异性和准确性，在肌内脂肪含量调控相关的分子标记辅助育种中具有重要的应用价值，对于培育具有优良肉品质性状的家禽品种和肉品质的改良具有重要意义。

技术领域

本发明涉及分子标记技术领域，具体涉及与肌内脂肪相关的分子标记载脂蛋白A1(APOA1)及其应用。

背景技术

肌内脂肪(IMF)是影响肉品质的重要因素之一，IMF是由肌内脂肪组织和肌纤维中的脂肪组成，含有大量的磷脂，磷脂携带大量的多不饱和脂肪酸，可通过脂质降解反应产生香味，改善肉的风味，且IMF的沉积可使肌肉中肌纤维、脂肪和结缔组织相互交叉结构疏松，从而减小物理强度，促进肌肉纤维束的分离，改善肌肉嫩度。因此，适当提高动物的肌内脂肪含量对于肉品质的改善具有重要意义。

鸡肉已成为世界第一大消费肉类，2017年鸡肉消费占肉类总比重的32.63％。近年来，长期以生长速度和繁殖性能为重点的育种方式，导致肉品质明显下降，制约了肉鸡产品特色的发挥和市场消费的增长。与猪、牛等大动物不同，鸡的IMF组织肉眼难以识别，解剖学上无法分离，很难对其IMF组织进行特异性研究和评价。鸡IMF组织的鉴别和含量检测的困难，对以提高肉品质为目标的肉鸡育种和生产提出了严峻的考验。因此，开发肌内脂肪细胞相关的分子标记对于具有优良肉品质动物的育种以及提高肉品质具有重要意义。

发明内容

为解决现有技术中的技术问题，本发明的目的在于提供与肌内脂肪相关的分子标记载脂蛋白A1及其应用。

为实现上述目的，本发明通过利用10×Genomics单细胞RNA测序技术，检测不同发育阶段的鸡胸肌组织分离的肌肉细胞和脂肪细胞混合细胞群，对获得转录组数据进行数据处理，分析肌肉细胞和脂肪细胞的转录组差异，筛选肌肉细胞和脂肪细胞差异表达基因，初步确定了IMF特异性表达的候选标识基因；进一步利用RNAscope原位表达检测技术定性检测候选标识基因的原位表达情况，以已知的肌肉细胞发育分子标记和脂肪细胞发育分子标记分别作为阴性对照和阳性对照，在候选基因中确定载脂蛋白A1在IMF与肌肉组织之间存在明显的差异表达；最后通过荧光定量PCR在更多群体中对载脂蛋白A1表达与IMF含量的相关性进行验证，确定载脂蛋白A1可作为IMF的特异性分子标记，用于评价IMF的含量高低。

具体地，本发明的技术方案如下：

第一方面，本发明提供载脂蛋白A1或其编码基因作为肌内脂肪细胞特异性分子标记的应用。

第二方面，本发明提供载脂蛋白A1、其编码基因或检测所述载脂蛋白A1或其编码基因表达的产品在分析肌内脂肪含量中的应用。

所述分析肌内脂肪含量具体可为判断肌内脂肪含量的高低。

第三方面，本发明提供载脂蛋白A1、其编码基因或检测所述载脂蛋白A1或其编码基因表达的产品在辅助鉴别肌内脂肪组织或肌内脂肪细胞中的应用。

第四方面，本发明提供载脂蛋白A1、其编码基因或检测所述载脂蛋白A1或其编码基因表达的产品在禽类肌内脂肪含量调控的分子标记辅助育种中的应用。

第五方面，本发明提供载脂蛋白A1、其编码基因或检测所述载脂蛋白A1或其编码基因表达的产品在提高禽类肌内脂肪含量或改善肉品质中的应用。

本发明中，所述载脂蛋白A1为非人动物的载脂蛋白A1或其突变体。

优选地，所述载脂蛋白A1为禽类载脂蛋白A1或其突变体。