[发明专利]小麦有效分蘖数QTL连锁的分子标记及其应用

说明书

本发明公开了小麦有效分蘖数QTL连锁的分子标记及其应用。所述小麦有效分蘖数QTL为QTL Qetn‑1B.1，所述分子标记命名为KASP‑1，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1～3所示。检测分析表明，该分子标记能准确跟踪小麦有效分蘖数QTL Qetn‑1B.1，预测小麦的有效分蘖数特性，进而方便进行分子设计育种。本发明还公开了一种鉴定小麦有效分蘖数QTL Qetn‑1B.1的分子标记的方法，利用本发明所提供的方法能够加强有效分蘖数的预测的准确性，以便快速筛选出具有增加有效分蘖数的小麦品种或品系用于育种，可大大加快小麦高产量品种的选育进程。

技术领域

本发明涉及分子生物学及作物遗传育种领域，具体涉及小麦有效分蘖数QTLQetn-1B.1连锁的SNP分子标记以及该分子标记的应用。

背景技术

普通小麦(Triticum aestivum L.)是世界上主要的粮食作物，每年种植面积约为450万公顷。由于全球可耕地面积的持续减少和人口的增加，迫切需要小麦年产量的快速增长。

构成小麦产量的3个因素为穗数、穗粒数和千粒重。每公顷穗数是根据有效分蘖数计算的，因此有效分蘖数是影响小麦产量的重要因素。分蘖是单子叶植物特有的分枝现象，因此它具有重要的研究意义。此外，分蘖决定植物的分枝结构，影响开花、株高和种子发育，并最终影响每株植物的籽粒产量。

小麦产量性状是复杂的数量性状，受多个数量性状基因位点(Quantitativetrait locus，QTL)控制，具有遗传力低、受环境影响大、选择难度高等特性，所以在选育过程中，传统的育种方法存在时间长、消费大、成本高、成果小等问题。分子标记辅助育种，不依赖于表型选择，不受环境和基因互作等因素的影响，而是直接对基因型进行选择，因而能大大提高育种效率。

单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism，SNP)指的是基因组内DNA某一特定核苷酸位置上存在转换、颠换、插入、缺失等变化而引起的DNA序列多态性。其技术是利用己知序列信息来比对寻找SNP位点，再利用发掘的变异位点设计特异性的引物来对基因组DNA或cDNA进行PCR扩增，得到基于SNP位点的特定的多态性产物，最后利用电泳技术分析产物的多态性。SNP标记的优点是数量多，分布广泛；在单个基因和整个基因组中分布不均匀；SNP等位基因频率容易估计。

KASP是由LGC公司(Laboratory of the Government Chemist)(http://www.lgcgenomics.com)研发的竞争性等位基因特异性PCR技术(Kompetitive AlleleSpecific PCR,KASP)具有低成本、高通量特点的新型基因分型技术，通过引物末端碱基的特异匹配来对SNP以及In Del位点进行精准的双等位基因分型，在水稻、小麦、大豆等作物的分子标记辅助选择中得到广泛应用。

此前许多学者对有效分蘖数进行了QTL定位，发现与之相关的QTL在小麦中广泛存在，并且分布在小麦的各个染色体上。然而目前与小麦有效分蘖数性状相关且可用于实际分子育种的紧密连锁的分子标记却并不多。因此研究获得有关有效分蘖数的QTL或基因，利用分子生物学技术，增加有效分蘖数，进而增加穗粒数，最终达到选育增产小麦新品种的目的，在小麦育种工作中意义重大。

发明内容

本发明的目的在于提供与小麦有效分蘖数QTL Qetn-1B.1紧密连锁的分子标记。

本发明的另一目的在于提供所述分子标记的荧光定量PCR引物。

本发明的第三个目的在于提供上述小麦有效分蘖数QTL Qetn-1B.1紧密连锁的分子标记的应用。

本发明的目的是通过以下技术方案实现的：