[发明专利]一种全自动显微影像荧光扫描系统有效
申请号: | 201911191764.2 | 申请日: | 2019-11-28 |
公开(公告)号: | CN110987886B | 公开(公告)日: | 2022-09-09 |
发明(设计)人: | 亓立峰 | 申请(专利权)人: | 上海纳奥生物科技有限公司 |
主分类号: | G01N21/64 | 分类号: | G01N21/64 |
代理公司: | 杭州裕阳联合专利代理有限公司 33289 | 代理人: | 姚宇吉 |
地址: | 201900 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 全自动 显微 影像 荧光 扫描 系统 | ||
本发明涉及荧光扫描技术领域,具体地说,涉及一种全自动显微影像荧光扫描系统。其包括Z轴自动聚焦定位载玻片上细胞图像,通过对每张图片清晰度计算完成自动聚焦。该发明的设计能够根据计算结果运行到清晰位置,实现自动聚焦,采用等比缩小图像,提升算法处理效率,并对图像进行灰度化、二值化处理,提取图像边缘和细胞区域,以便于计算清晰度。同时,本发明公开了细胞内荧光原位杂交探针染色点的自动聚焦与自动识别方法,以及符合阳性细胞判读标准的自动判读方法。通过对符合细胞形态、尺寸、以及探针染色点数的细胞进行自动识别判断实现细胞的自动计数功能。
技术领域
本发明涉及荧光扫描技术领域,具体地说,涉及一种全自动显微影像荧光扫描系统。
背景技术
随着社会的进步,光电子技术的发展,尤其是激光技术的发展,越来越多的现代显微技术迅速发展起来。利用光扫描技术对样品进行无创动态测量的荧光扫描系统,目前已经发展成为生物学和医学研究诊断的重要工具。显微影像荧光扫描以光学系统的共焦成像为基础,因此聚焦的效果直接影响到扫描最终的效果。我们专利核心在于FISH探针点自动识别与计数,包括细胞自动聚焦,细胞内染色探针点的自动识别,阳性细胞自动判读。
发明内容
本发明的目的在于提供一种全自动显微影像荧光扫描系统,以解决上述背景技术中提出的问题。
为实现上述目的,本发明提供一种全自动显微影像荧光扫描系统,其方法包括如下步骤:
S1:设定好扫描区域,输入X轴和Y轴扫描数量;
S2:X轴、Y轴、Z轴聚焦电机到起始位;
S3:Z轴聚焦电机大范围定位,查找载玻片大概的聚焦位置;
S4:计算扫描图像的清晰度;
S5:Z轴聚焦电机根据计算结果的反馈运行到清晰位置,若反馈的清晰度值为0,X轴移动到下一个视野在继续查找清晰度,当达到阈值时停止查找;
S6:大范围聚焦完成后,在当前视野的上下小范围内再次聚焦,此次为最清晰聚焦;
S7:开始执行载玻片扫描动作,根据X轴和Y轴设定的扫描数量,开始逐行扫描;
S8:Z轴聚焦电机根据计算结果运行到清晰位置;
S9:采用关键区域的梯度累加进行计算判断;
S10:扫描过程中,若聚焦值连续多次出现为0的情况,机器会自动回零,并提示扫描失败;
S11:计算清晰度流程中的细胞提取操作;
S12:分析阳性细胞。
作为优选,所述S4中,计算扫描图像的清晰度的步骤如下:
S4.1、加载图像流A,对每张图像A[i]进行清晰度计算,清晰度为C[i];
S4.2、计算单张图像的清晰度C[i];
S4.3、计算出清晰度,记录A中每张图像的清晰度,得到清晰度值最大图像的索引,即为最清晰图像Abest,则完成聚焦操作。
作为优选,所述S4.2中,计算单张图像的清晰度C[i]步骤如下:
S4.2.1、等比缩小图像,图像尺寸为w*h,如果wh,A[i]=resize(A[i],Size(800,h*800/w));如果wh,A[i]=resize(A[i],Size(w*800/h,800));
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