[发明专利]用于欧鳇和闪光鲟物种鉴定的SSR引物对组、试剂盒、鉴定方法及应用有效
| 申请号: | 201911168829.1 | 申请日: | 2019-11-25 |
| 公开(公告)号: | CN110846419B | 公开(公告)日: | 2023-05-26 |
| 发明(设计)人: | 张书环;杜浩;张辉;阮瑞;危起伟 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院长江水产研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司: | 深圳泛航知识产权代理事务所(普通合伙) 44867 | 代理人: | 邓爱军 |
| 地址: | 430070 湖北省武汉市*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 闪光 物种 鉴定 ssr 引物 试剂盒 方法 应用 | ||
本发明涉及一种用于欧鳇和闪光鲟物种鉴定的SSR引物对组、试剂盒、鉴定方法及应用,其包括正向引物P3‑89F和反向引物P3‑89R,其中正向引物P3‑89F具有如SEQ ID NO.1所示核苷酸序列,反向引物P3‑89R具有如SEQ ID NO.2所示核苷酸序列。本发明可以实现欧鳇和闪光鲟间的快速种间鉴定,且鉴定结果准确。
技术领域
本发明属于水产动物种质鉴定领域,具体涉及用于欧鳇和闪光鲟种间鉴定的SSR引物对组、试剂盒、鉴定方法及应用。
背景技术
鲟鱼,即鲟形目鱼类(Acipenseriformes),是古老的软骨硬磷鱼类,起源于白垩纪时期,迄今已有2亿年的历史,素有“水中活化石”之称。其骨可成胶、肉质细腻、味道鲜美,营养价值高,尤其是鲟鱼子酱富含优质蛋白质、氨基酸和微量元素,被誉为“黑色黄金”,与鹅肝、松露并称为世界三大美食。随着鲟鱼养殖业的快速发展,我国已经成为世界鲟鱼养殖第一大国。目前生产鱼子酱的养殖品种主要以杂交鲟和外来鲟为主,其中外来鲟欧鳇(Husohuso)和闪光鲟(Acipenser stellatus)生产的鱼子酱价值最高,在我国人工养殖的比重逐年增加,进一步的,随着鱼子酱进出口贸易的法制化,鱼子酱品种鉴定越来越收到重视。
此外,欧鳇和闪光鲟等外来鲟的大范围养殖中可能会出现,导致其与我国特有的中华鲟、长江鲟、施氏鲟等进行杂交繁殖,造成遗传污染。
综上所述,对欧鳇和闪光鲟等进行快速、准确的物种鉴定具有重要的意义。但由于欧鳇和闪光鲟属于多倍体鲟鱼,遗传鉴定较二倍体鱼类更为复杂,截止目前,有关欧鳇和闪光鲟种质、种间和相关的副产品等的简便、快速和有效的鉴定方法尚未建立。
发明内容
本发明针对上述现有技术中的缺陷,提供了一种用于欧鳇和闪光鲟种间鉴定的SSR引物对组、试剂盒、鉴定方法及应用,其可以实现欧鳇和闪光鲟间的快速种间鉴定,且鉴定结果准确。
本发明为解决上述技术问题所提供的技术方案如下:
一方面,提供了一种用于欧鳇和闪光鲟物种鉴定的SSR引物对组,其包括正向引物P3-89F和反向引物P3-89R,其中正向引物P3-89F具有如SEQ ID NO.1所示核苷酸序列,反向引物P3-89R具有如SEQ ID NO.2所示核苷酸序列。
优选的,所述正向引物P3-89F可用荧光染料进行标记。
一方面,提供了一种用于欧鳇和闪光鲟物种鉴定的试剂盒,其包括上述SSR引物对组。
优选的,所述试剂盒还包括:水、PCR缓冲液、dNTPs、DNA聚合酶、上样缓冲液中的一种或多种。
一方面,提供了一种欧鳇和闪光鲟间的物种鉴定方法,其包括如下步骤:
S1、提取待鉴定的欧鳇和闪光鲟的DNA样本;
S2、合成上述SSR引物对组,且利用所述SSR引物对组、以步骤S1中获取的DNA样本为模板进行PCR扩增;
S3、对经步骤S2获得的PCR扩增产物进行检测,以获得PCR扩增产物多态性原始数据;
以及S4、对PCR扩增产物多态性原始数据进行分析,以得出测序峰图数据,并根据所述测序峰图数据对欧鳇和闪光鲟进行鉴定。
优选的,在进行PCR扩增时,所述正向引物P3-89F的退火温度为50~60℃;所述反向引物P3-89R的退火温度为50~58℃。
优选的,在进行PCR扩增时,所述正向引物P3-89F与反向引物P3-89R的退火温度均为52℃。
另一方面,还提供一种上述SSR引物对组和/或上述试剂盒和/或上述鉴定方法在欧鳇和闪光鲟的种间鉴定/种质鉴定/家系管理中应用。
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