[发明专利]一种生物信息数据库的构建方法和装置在审
| 申请号: | 201911168645.5 | 申请日: | 2019-11-25 |
| 公开(公告)号: | CN111078692A | 公开(公告)日: | 2020-04-28 |
| 发明(设计)人: | 李亚萍;侯林勇;方程;王俊;刘婉莹;张亮;袁率;杨坤 | 申请(专利权)人: | 贵州小叮当信息技术有限公司 |
| 主分类号: | G06F16/22 | 分类号: | G06F16/22;G06F21/62;G06K9/00;G06K9/62 |
| 代理公司: | 重庆百润洪知识产权代理有限公司 50219 | 代理人: | 陈付玉 |
| 地址: | 550008 贵州省贵阳市国家高新技*** | 国省代码: | 贵州;52 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 生物 信息 数据库 构建 方法 装置 | ||
本发明公开了一种生物信息数据库的构建方法和装置,包括以下步骤:A、首先数据采集单元采集生物信息数据;B、采集的生物信息数据传输至数据分类单元中进行分类处理;C、将分类后的生物信息数据通过数据传输单元传输至主控单元,主控单元经过处理后传输至存储单元中进行加密存储;D、最后,加密存储后的数据通过安全传输网络传输至后台生物信息数据库,本发明能够实时采集生物信息数据,能够对采集的生物信息数据进行分类、加密存储和安全传输,提高了数据库构建效率,同时能够防止数据泄露,安全性高。
技术领域
本发明涉及数据库构建技术领域,具体为一种生物信息数据库的构建方法和装置。
背景技术
数据库,简而言之可视为电子化的文件柜——存储电子文件的处所,用户可以对文件中的数据运行新增、截取、更新、删除等操作;所谓“数据库”系以一定方式储存在一起、能予多个用户共享、具有尽可能小的冗余度、与应用程序彼此独立的数据集合。一个数据库由多个表空间构成。
已知生物信息数据库种类繁多,一般划分为一次数据库和二次数据库两类。一次数据库包括例如基因组数据库、核酸和蛋白质一级结构序列数据库、以及生物大分子三维空间结构数据库。二次数据库是以一次数据库和文献资料为基础而构建。根据生命科学不同研究领域的实际需要,对基因组图谱、核酸和蛋白质序列、蛋白质结构以及文献等数据进行分析、整理、归纳、注释,构建具有特殊生物学意义和专门用途的二次数据库,是生物信息数据库开发的有效途径。从应用角度来说,与疾病相关的突变具有最重要的研究价值,需要一个来自前沿、信息全面、可快速更新的数据库。同时,由于突变信息的数据量大,更新速度快,人工收集不仅成本高、速度慢,还存在信息遗漏和可信度低等问题。有必要对现有的数据库构建方法进行改进。
发明内容
本发明的目的在于提供一种生物信息数据库的构建方法和装置,以解决上述背景技术中提出的问题。
为实现上述目的,本发明提供如下技术方案:一种生物信息数据库的构建方法,包括以下步骤:
A、首先数据采集单元采集生物信息数据;
B、采集的生物信息数据传输至数据分类单元中进行分类处理;
C、将分类后的生物信息数据通过数据传输单元传输至主控单元,主控单元经过处理后传输至存储单元中进行加密存储;
D、最后,加密存储后的数据通过安全传输网络传输至后台生物信息数据库。
优选的,所述步骤B中数据分类单元分类方法包括以下步骤:
a、将采集的生物信息数据压缩成数据样本,并对压缩后的数据样本进行等分,分成多个子数据集;
b、基于Adaboost算法使用多个弱分类器对多个子数据集进行训练;
c、对训练后的子数据集执行多次RIPPER分类,每次RIPPER分类后根据分类结果对子数据集中特征属性再次进行筛选,将筛选后子数据集样本重新进行RIPPER分类,得到最终的训练子数据集;
d、根据数据属性,对训练子数据集进行分类,输出分类结果。
优选的,所述步骤C中加密存储方法如下:
a、将待存储的生物信息数据传输至本地加密盘进行一次加密,其中一次加密算法为HASH加密算法;
b、将一次加密后的数据进行压缩,得到压缩后的加密数据;
c、将外部存储器进行分区,并对每个存储区进行单独标识;
d、将压缩后的数据分割成对个数据段,且对每个数据段进行标识;
e、将每个数据段对应存储至存储区中,并进行二次加密,其中,二次加密算法为3DES算法。
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