[发明专利]DNA参照标准及其应用在审
申请号: | 201911146777.8 | 申请日: | 2019-11-20 |
公开(公告)号: | CN110885883A | 公开(公告)日: | 2020-03-17 |
发明(设计)人: | 杨淑伟;黄连成;梁晨;陈韵仪;陈海英 | 申请(专利权)人: | 广州易锦生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 中科专利商标代理有限责任公司 11021 | 代理人: | 张莹 |
地址: | 510663 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | dna 参照 标准 及其 应用 | ||
1.参照DNA,其选自以下各项组成的组:
(i)DNA片段1:其特征在于,携带确定的基因突变和至少有另一个进行了人工改变的碱基X2,其中与基因的野生型相比,所述确定的基因突变中至少有一个确定的碱基X1发生了与疾病(如肿瘤)发生、诊断和/或治疗(例如药物针对的靶点)相关的突变,所述突变是置换突变、缺失突变和/或插入突变,所述人工改变的碱基X2区别于待检样品含有的、确定的与疾病发生、诊断和/或治疗相关的突变碱基X1,
(ii)DNA片段2:其特征在于所述DNA片段2包含(i)中所述的人工改变的碱基X2,与DNA片段1的区别仅在于不包含所述确定的碱基X1突变,或
(iii)DNA片段1和DNA片段2的混合物。
2.根据权利要求1所述的参照DNA,其中所述碱基X2位于所述确定的碱基X1的上游、下游、或两者的任意位置。
3.根据权利要求1所述的参照DNA,其中所述DNA片段1和DNA片段2是双链DNA。
4.根据权利要求1所述的参照DNA,其特征在于,所述(i)中的突变为置换突变时,所述确定的碱基X1与所述碱基X2之间的间隔为1bp、2bp、3bp、4bp、5bp、10bp以内、100bp以内、500bp以内、1kp以内、2kp以内、10kp以内或100kp以内,
优选地,
(a)当将包含所述确定的碱基X1突变的密码子中的第三个碱基的位置设定为0时,并且所述碱基X2位于所述确定的碱基X1的上游时,所述碱基X2的位置由3n表示,其中n为正整数,优选地,所述碱基X2的改变不会造成原有氨基酸编码的变化,或
(b)当将包含所述确定的碱基X1突变的密码子中的第三个碱基的位置设定为0时,并且所述碱基X2位于所述确定的碱基X1的下游时,所述碱基X2的位置由-3n表示,其中n为正整数,优选地,所述碱基X2的改变不会造成原有氨基酸编码的变化;或
(c)当将包含所述确定的碱基X1突变的密码子中的第三个碱基的位置设定为0时,并且所述碱基X2分别位于所述确定的碱基X1的上游和下游时,位于所述确定的碱基X1上游的所述碱基X2的位置由3n表示,位于所述确定的碱基X1下游的X2的位置由-3n表示,其中n均为正整数,优选地,所述碱基X2的改变不会造成原有氨基酸编码的变化。
5.根据权利要求4所述的参照DNA,其特征在于,所述(i)中的突变是连续置换或离散置换,优选同一个密码子的第1和第2个连续碱基的置换突变。
6.根据权利要求1所述的参照DNA,其特征在于,所述(i)中的突变为缺失突变时,所述确定的碱基X1与所述碱基X2之间的间隔为1bp、2bp、3bp、4bp、5bp、10bp以内、100bp以内、500bp以内、1kp以内、2kp以内、10kp以内或100kp以内,
优选地,
(a)当与基因的野生型相比,在一个碱基位置缺失一个所述确定的碱基X1,或者连续在多个碱基位置缺失多个所述确定的碱基X1,并且所述碱基X2位于缺失的所述确定的碱基X1的上游时,将紧邻所述确定的碱基X1上游的对应于基因的野生型的第一个密码子的第三个碱基位置设定为0,所述碱基X2的位置由3n表示,其中n为正整数,优选地,所述碱基X2的改变不会造成原有氨基酸编码的变化;
(b)当与基因的野生型相比,在一个碱基位置缺失一个所述确定的碱基X1,或者连续在多个碱基位置缺失多个所述确定的碱基X1,并且所述碱基X2位于缺失的所述确定的碱基X1的下游时,所述碱基X2位于所述确定的碱基X1下游的任意位置;
(c)当与基因的野生型相比,在一个碱基位置缺失一个所述确定的碱基X1,或者连续在多个碱基位置缺失多个所述确定的碱基X1,并且所述碱基X2分别位于所述确定的碱基X1的上游和下游,当所述碱基X2位于所述碱基X1的上游时,所述碱基X2的定义如(a)中所述,当所述碱基X2位于所述确定的碱基X1的下游时,所述碱基X2的定义如(b)中所述,优选地,所述碱基X2的改变不会造成原有氨基酸编码的变化。
7.权利要求6所述的参照DNA,其特征在于,在(a)-(c)的情形中,所述缺失是连续缺失或离散缺失。
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