[发明专利]一种特定代谢通路中代谢物的仪器检测方法在审
申请号: | 201911135981.X | 申请日: | 2019-11-19 |
公开(公告)号: | CN112903880A | 公开(公告)日: | 2021-06-04 |
发明(设计)人: | 张保琴;罗云;耿柠波;宋肖垚;张海军;陈吉平 | 申请(专利权)人: | 中国科学院大连化学物理研究所 |
主分类号: | G01N30/72 | 分类号: | G01N30/72;G01N30/88 |
代理公司: | 大连东方专利代理有限责任公司 21212 | 代理人: | 毛薇;李馨 |
地址: | 116000 辽宁*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 特定 代谢 通路 代谢物 仪器 检测 方法 | ||
1.一种特定代谢通路中代谢物的仪器检测方法,其特征在于:包括以下步骤:
a)代谢物的检索分类:检索KEGG数据库,按照不同的代谢通路,检索代谢物,按照代谢物的CAS号,检索METLIN数据库,在数据库中确定该代谢物的精确质量数,离子化方式,碰撞能及母离子和子离子参数;
b)细胞代谢物的提取:将细胞加入甲醇溶液中,于冰水中超声、涡旋;加入甲基叔丁基醚冰水中超声、涡旋,然后加入超纯水、离心,分别取上层和下层提取物备用;
c)UPLC-Q/TOF的定性分析:将步骤b)得到的上层和下层提取物分别进行UPLC-Q/TOF直接进样分析,寻找符合代谢物特征的化合物,当精确质量数、子离子、母离子、碰撞能及离子丰度比都符合,就可以确定此化合物即为所寻找的代谢物;
d)UPLC-QQQ的定量分析:将步骤c)寻找到的代谢物的特征信息编辑到UPLC-QQQ的方法文件中,采用UPLC-QQQ的MRM模式检测,对代谢物进行定量分析;
e)全代谢网络的代谢组检测平台构建:选择多条代谢通路,数据库查找及其仪器识别相关联获得代谢物信息,按照步骤b)所述方法提取细胞代谢产物,分别对上层提取物和下层提取物进行定性、定量检测,以对全代谢网络的代谢物进行检测。
2.根据权利要求1所述的特定代谢通路中代谢物的仪器检测方法,其特征在于:步骤a)中的代谢通路是KEGG数据库中包含的所有代谢通路。
3.根据权利要求2所述的特定代谢通路中代谢物的仪器检测方法,其特征在于:所述KEGG数据库中包含的所有代谢通路包括动物代谢通路和植物代谢通路。
4.根据权利要求1所述的特定代谢通路中代谢物的仪器检测方法,其特征在于:步骤c)中采用UPLC-Q/TOF直接进样分析,进样的细胞浓度是106个/mL提取液;步骤c)中直接进样的分析过程中,四级杆质谱筛选目标离子,飞行时间质谱鉴定精确质量数。
5.根据权利要求1所述的特定代谢通路中代谢物的仪器检测方法,其特征在于:步骤d)中UPLC-QQQ的方法文件在一个模式中可以编辑300个化合物;步骤d)中将代谢物的特征信息编辑到UPLC-QQQ的方法文件的方法为:首先编辑不包含保留时间的方法文件,此文件每次放入50个代谢物,此方法用于确认每个化合物的保留时间,每个化合物的时间确认后再次编辑包括保留时间的方法文件,即可进行后续检测;步骤d)中检测结果出现的非单一峰化合物,需要结合化合物的性质定位目标峰。
6.根据权利要求1所述的特定代谢通路中代谢物的仪器检测方法,其特征在于:步骤a)中METLIN数据库中的质谱图不具有唯一性,需筛选干扰最小,响应最大的质谱图。
7.根据权利要求1所述的特定代谢通路中代谢物的仪器检测方法,其特征在于:步骤b)中甲醇溶液的浓度为75%,冰水中超声1min,涡旋1min;加入甲基叔丁基醚的量为300μL,冰水中超声1min,涡旋1min,加入超纯水的量为75μL,离心转速为20000r/min。
8.根据权利要求1所述的特定代谢通路中代谢物的仪器检测方法,其特征在于:步骤c)的UPLC-Q/TOF条件为:电喷雾离子源ESI温度为550℃,喷雾电压为5500V,碰撞能0V,15V,30V,45V。
9.根据权利要求1所述的特定代谢通路中代谢物的仪器检测方法,其特征在于:步骤d)的UPLC-QQQ的正离子模式质谱参数为:电喷雾离子源ESI温度为550℃,喷雾电压为5500V,气帘气压力为0.241MPa,Gas1压力为0.276MPa,Gas2压力为0.276MPa;负离子模式质谱参数为:电喷雾离子源ESI温度为550℃,喷雾电压为4500V,气帘气压力为0.241MPa,Gas1压力为0.276MPa,Gas2压力为0.276MPa。
10.根据权利要求1所述的特定代谢通路中代谢物的仪器检测方法,其特征在于:步骤d)的UPLC-QQQ中的色谱条件为:
正离子模式:色谱柱用ACQUITY UPLC BEH C8,2.1mm×100mm,1.7μm,柱温为50℃,进样量为10μL;流动相A为含甲酸0.1%(v/v)的超纯水,B相为含甲酸0.1%(v/v)的乙腈;流动相梯度为0-3min,90%,350μL/min,3-15min,100%,350μL/min,15-20min,100%,350μL/min,20-21min,100%,350μL/min,21-23min,90%,350μL/min;
负离子模式:色谱柱为ACQUITY UPLC HSS T3,2.1mm×100mm,1.8μm,柱温为50℃,进样量为10μL;流动相A为5mM NH4HCO3的水,B为含5mM NH4HCO3的甲醇;流动相梯度为0-1min,2%,350μL/min,1-3min,2%,350μL/min,3-12min,42%,350μL/min,12-16min,100%,350μL/min,16-17min,2%,350μL/min,17-20min,2%,350μL/min。
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