[发明专利]小鼠巨细胞病毒核酸检测方法在审

专利信息
申请号: 201911067290.0 申请日: 2019-11-04
公开(公告)号: CN110684868A 公开(公告)日: 2020-01-14
发明(设计)人: 吕亚丽;刘丽宏;万子睿;安卓玲;刘河;贾阳杰;宫丽丽;玄玲玲;韩菲菲 申请(专利权)人: 首都医科大学附属北京朝阳医院
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/686
代理公司: 11369 北京远大卓悦知识产权代理事务所(普通合伙) 代理人: 史霞
地址: 100020*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 检测 基因引物 扩增产物 小鼠巨细胞病毒 标准曲线 检测样 构建 定量检测细胞 鼠巨细胞病毒 荧光定量PCR 巨细胞病毒 标准质粒 定量检测 定性检测 核酸检测 小数 核酸 尿液 全血 小鼠 血浆 脏器 定性
【权利要求书】:

1.小鼠巨细胞病毒核酸检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

S1、标准质粒的构建,其包括:

S1.1、培养小鼠胚胎成纤维细胞NIH/3T3细胞株获得单层小鼠NIH/3T3细胞,

向单层小鼠NIH/3T3细胞中接种小鼠MCMV Smith病毒株,培养得病毒感染液,病毒感染液提取获得MCMV DNA产物;

S1.2、以MCMV DNA产物作为模板进行PCR扩增,获得MCMV-ie基因引物扩增产物;

S1.3、MCMV-ie基因引物扩增产物进行2%琼脂糖凝胶电泳后切胶回收目的DNA,得切胶回收产物,切胶回收产物连接PMD-18T载体,得连接产物,连接产物转化后进行质粒DNA提取,得标准质粒;

S2、检测标准曲线的构建,具体为:将标准质粒用ddH2O进行5倍系列稀释,得五个梯度的稀释液,以稀释液作为模板,进行荧光定量PCR,建立以起始模板对数为X轴、CT值为y轴的标准曲线;

S3、待检测样提取获得待检测DNA产物,以待检测DNA产物作为模板进行PCR扩增,获得待检测DNA基因引物扩增产物,待检测DNA基因引物扩增产物进行荧光定量PCR,获得CT值,并依据标准曲线获得待检测DNA基因引物扩增产物浓度,以定性及定量检测待检测样中的小数巨细胞病毒。

2.如权利要求1所述的小鼠巨细胞病毒核酸检测方法,其特征在于,步骤1.2具体为:依据MCMV DNA产物设计得上游基因引物、下游基因引物;

确定反应体系,其中,每50μL的扩增体系包括39.5μL的ddH2O、2μL的浓度为50ng/μL的DCMV DNA产物、0.5μL的酶E、1μL的浓度为10uM的下游基因引物、1μL的浓度为10uM的下游基因引物、1μL的dNTP、5μL的10×PCR buffer;

根据反应体系依次向PCR试剂管中加样,将加好样品的PCR试剂管放入荧光PCR仪中,设置PCR扩增循环参数进行扩增反应,得到MCMV-ie基因引物PCR扩增产物,存于4℃,其中,PCR扩增循环参数具体为:95℃预变性5min,1个循环;95℃变性30s,60℃退火30s,72℃延伸15s,共35个循环;72℃延伸10min;

其中,上游基因引物的序列为:5-TCAGCCATCAACTCTGCTACCAAC-3;

下游基因引物的序列为:5-ATCTGAAACAGCCGTATATCATCTTG-3.。

3.如权利要求1所述的小鼠巨细胞病毒核酸检测方法,其特征在于,步骤S1.3中切胶回收具体包括:

a、从琼脂糖凝胶中切下含目的DNA片段的胶块,放入离心管中,并称量;

b、按照与胶块的质量体积为1mg:1mL加入溶胶液PN,50℃水浴加热至胶块完全溶解,得胶块溶解液,其中,水浴期间每隔2-3min颠倒离心管一次;

c、将平衡液BL加到吸附柱中,静置2min,离心,弃去滤过液;

d、将胶块溶解液加到吸附柱中,离心,弃去滤过液;

e、向吸附柱中加入漂洗液PW,离心,弃去滤过液,重复该操作2次,得空载吸附柱;

f、将空载吸附柱进行空转离心,弃去滤过液,并将吸附柱在室温下放置晾干;

g、向膜中间悬空加入洗脱缓冲液EB,离心收集DNA滤液,得切胶回收产物。

4.如权利要求3所述的小鼠巨细胞病毒核酸检测方法,其特征在于,步骤S1.4中切胶回收产物连接PMD-18T载体具体为:

在EP管中配置连接体系,其中,每10μL的连接体系包括:1μL的PMD-18T载体、1μL的切胶回收产物、3μL的Solution Buffer、5μL的ddH2O;

将装载有连接体系的EP管置于16℃反应30min,得连接产物。

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