[发明专利]一种预示和鉴定鸡腹脂重的分子标记方法

说明书

本发明公开了一种预示和鉴定鸡腹脂重的分子标记方法，属于分子标记方法技术领域为了解决无法从表型上对鸡腹脂重进行判断，本发明提供了一种预示和鉴定鸡腹脂重的分子标记方法，具体方案是根据鸡TCF21基因SNP位点g.1033GA上下游394bp序列设计引物，再根据所得引物进行鸡基因组DNA的PCR扩增，之后利用限制性内切酶对扩增产物进行酶切，再对酶切产物进行电泳分离，获得肉鸡腹脂重的标记基因型。本发明所提供的方法具有操作简单、费用低、精确度高的特点，可进行自动化检测，是一种有效的分子标记育种手段，可大幅度加快鸡的育种进程。

技术领域

本发明涉及一种预示和鉴定鸡腹脂重的分子标记方法，属于分子标记方法技术领域。

背景技术

肉鸡是人类最普遍饲养的家禽，上世纪五十年代以来，育种企业依赖于表型选择的方法对肉鸡生长速度和产肉量性状进行了选择，已经使肉鸡的生产性能得到了显著提升，但是伴随着肉鸡生长速度的快速提升，一些生理性不适应症等负面问题随之出现，比如腹脂蓄积过多、腹水综合症、腿部生长发育疾病、肉鸡免疫力下降、猝死症等，这些问题给肉鸡养殖企业造成了巨大的经济损失。肉鸡适量的腹脂沉积是机体生理所必需的，然而，过量的腹脂沉积则会导致肥胖、高血压等疾病，并且会增加饲养成本，因此，选育低脂节粮型肉鸡配套系已经成为世界范围内肉鸡育种的重要奋斗目标之一。

腹脂的过度沉积会降低肉仔鸡饲料转化效率，因为沉积单位重量的脂肪比沉积相同质量的肌肉多消耗三倍的能量，而且肉种鸡过胖会影响产蛋率、受精卵、孵化率等繁殖性状。肉鸡的腹脂沉积主要由遗传、营养、环境因素影响，而从长远来看，解决腹脂过度沉积最有效的方法是遗传手段。另外，有文献报道，肉鸡的生长速度与生理适应性状呈负相关，所以应用传统的表型选择同时提高生长速度和改善肉鸡生理适应性状是困难的，通过分子标记辅助选择可以为解决这一矛盾提供新思路。肉鸡大多数重要经济性状都属于数量性状，而数量性状不仅受许多微效基因调控，而且还有可能受到一个或几个主效基因控制，所以将分子遗传标记育种与传统表型选择相结合能极大提高育种效率，加快育种进展。近年来，随着分子遗传学的迅猛发展，遗传标记逐渐被应用于畜禽的标记辅助选择，此项技术可大大提高育种效率、缩短世代间隔。在众多的分子标记中，关于单核苷酸多态性(singlenucleotide polymorphism,SNP)标记辅助选择的研究最多，也是最具前景的分子遗传标记，因此开展与肉鸡重要经济性状相关基因多态性的研究具有现实意义。

目前为止，尚未发现有以TCF21基因g.1033GA位点基因型作为分子标记对鸡腹脂重进行选择的报道。

发明内容

为了解决无法从表型上对鸡腹脂重进行判断，本发明提供了一种预示和鉴定鸡腹脂重的分子标记方法，所采取的技术方案如下：

1)根据鸡TCF21基因SNP位点g.1033GA上下游394bp序列设计引物TCF21-F和TCF21-R，获得扩增引物；

2)提取鸡的基因组DNA；

3)利用步骤1)所得的扩增引物以步骤2)提取的DNA为模板，进行鸡基因组DNA的PCR扩增，获得扩增产物；

4)利用限制性内切酶HinP1I对步骤3)所得的扩增产物进行酶切，获得酶切产物；

5)利用琼脂糖凝胶对步骤4)所得的酶切产物进行电泳分离，根据电泳分离结果进行基因型判定，比较各基因型对应的鸡的腹脂重，确定鸡的腹脂重标记基因型，即完成预示和鉴定鸡腹脂重；

步骤1)中所述引物TCF21-F序列如SEQ ID No：1所示；所述引物TCF21-R如SEQ IDNo：2所示；