[发明专利]一种与油菜抗裂角性状相关的核苷酸序列及应用

说明书

本发明涉及油菜育种领域，公开了一种与油菜抗裂角性状相关的核苷酸序列及应用。申请人通过甘蓝型油菜品系R1和R2杂交，生成DH分离群体，DH群体的基因型数据以及多年的抗裂角性状数据输入WinQTLcart2.5软件进行QTL定位，对该群体亲本进行了基因组重测序分许，挖掘目标区间内部的序列差异，发现有基因核苷酸序列产生了导致转录等活性较大变异，最终获得了与甘蓝型油菜抗裂角性相关的核苷酸序列，所述的序列为SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.2所示。针对这两个序列的差异设计引物，可用于油菜抗裂角的筛选。

技术领域

本发明涉及油菜育种领域，具体涉及一种与油菜抗裂角性状相关的核苷酸序列及应用。

背景技术

油菜是世界三大油料作物之一，也是我国第一大油料作物，我国油菜总产约占世界20％左右。油菜不仅能提供健康菜籽油，还能提供功能型菜薹、蜜用、饲用、肥用、休闲观光等多方位价值。我国油菜产量实现了三次飞跃，目前制约我国油菜产业进一步发展的是机械化程度不高，缺少适合于机械化收获的抗裂角油菜品种。

角果开裂对植物后代的繁殖和进化具有重要意义，但角果开裂却给作物种子收获的农业生产带来损失。在角果开裂这一性状上，植物进化和作物驯化是一个反向选择(Dong等，2015)。由于目前生产上利用的甘蓝型油菜品种在成熟时特别容易裂角，人工收获一般会造成大约10％的产量损失，机械化收割则损失更加严重。如遇到恶劣气候，产量损失可高达50％以上(Kadkol等，1984；Wang等，2007)。而且裂角散失的籽粒萌发形成自生苗，不但影响下茬作物的生长，同时也增加了施用除草剂去除再生苗的成本(等，2006)。目前生产上采取提前收获的方法避免裂角造成的产量损失和对下茬作物的不良影响，但该措施会造成油菜籽中叶绿素含量增加，油含量下降及品质降低。因此，努力提升栽培油菜品种角果裂角抗性是实现机械化生产，稳定收获产量和保证油菜籽品质的一项紧迫任务。

利用拟南芥中已克隆的与角果发育和开裂有关的基因，来抑制油菜角果开裂的工作取得了较好的进展(Mummenhoff等，2009)。Dinneny等(2005)和Ferrandiz等(2000)利用RNAi技术抑制油菜角果果瓣边缘SHP、IND和ALC基因表达，控制油菜角果开裂； aard等(2006)采用农杆菌介导法将35S：FUL基因转入黑芥(B.nigra)中，发现FUL基因在果瓣中异常表达，抑制了对果瓣边缘层的识别和发育，果瓣边缘层被当作果瓣细胞来发育，使角果不开裂。Salentijn等(2007)将拟南芥中的抗裂角基因导入油菜，得到了抗裂角的油菜种质。Braatz等(2017和2018)通过基因编辑和筛选突变体库，获得ALC，IND和FUL的抗性资源材料。

近年来，随着油菜分子生物学的迅速发展，许多控制油菜裂角的QTL已被定位，但对应抗裂角QTL位点下的关键基因及功能分子标记还没有利用的报道，针对上述问题，本发明提供了一种与油菜抗裂角性状相关的核苷酸序列，针对该序列设计引物可对油菜抗裂角性状进行高效筛选，加快油菜育种进程。

发明内容

本发明提供了一种与甘蓝型油菜抗裂角性相关的核苷酸序列，所述的序列为SEQID NO.1或SEQ ID NO.2所示。

本发明的另一个目的在于提供了一种针对SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示序列差异性设计的引物组，所述的的引物组为：PF4-F:TATCCAGGATCCACACGGGA、PF4-R:ACCTGTAGCTGCGGAAAGTG、PF5-F:GTCACACTACGGGGCGTTTA和PF5-R:TTTGATCTGAGAGCATCATCCG。

本发明的最后一个目的在于提供了一种针对SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示序列差异性设计的引物组的应用，该引物组可用于甘蓝型油菜的育种，特别是抗裂角性状相关的筛选育种。

为了达到上述目的，本发明采取以下技术措施：

一种与甘蓝型油菜抗裂角性相关的核苷酸序列的获得：