[发明专利]一种迟缓爱德华氏菌快速检测方法在审
| 申请号: | 201910979356.7 | 申请日: | 2019-10-15 |
| 公开(公告)号: | CN110714058A | 公开(公告)日: | 2020-01-21 |
| 发明(设计)人: | 庞建虎;高威芳;张顺;蔡挺 | 申请(专利权)人: | 中国科学院大学宁波华美医院(宁波市第二医院) |
| 主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844;C12Q1/689;C12Q1/10;C12N15/11;C12R1/01 |
| 代理公司: | 33261 杭州橙知果专利代理事务所(特殊普通合伙) | 代理人: | 贺心韬 |
| 地址: | 315099*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 迟缓爱德华氏菌 基因组DNA 快速检测 等温扩增反应 检测技术领域 扩增产物稀释 病害微生物 检测试纸条 低灵敏度 反向引物 扩增产物 阳性反应 振荡混匀 正向引物 反应管 缓冲液 加样区 检测菌 启动剂 上清液 检测 滴加 冻干 混匀 酶粉 探针 费力 | ||
本发明提供了一种迟缓爱德华氏菌快速检测方法,属于病害微生物检测技术领域。它解决了现有检测迟缓爱德华氏菌费力、费时和低灵敏度等问题,一种迟缓爱德华氏菌快速检测方法,包括如下步骤:S01:提取待检测菌的基因组DNA;S02:将正向引物、反向引物、RPA探针、缓冲液和步骤S01中的基因组DNA混匀后,加入冻干酶粉,振荡混匀后离心,将上清液转移到反应管中,加入启动剂进行恒等温扩增反应,得到扩增产物;S03:将扩增产物稀释后滴加到LFD检测试纸条上的加样区,若出现阳性反应,则存在迟缓爱德华氏菌。本发明检测时间短等优点。
技术领域
本发明属于病害微生物检测技术领域,特别涉及一种迟缓爱德华氏菌快速检测方法。
背景技术
由迟缓爱德华氏菌(Edwardsiella tarda)引起的爱德华菌病是水产养殖业最为重要的传染性疾病之一,给水产养殖业造成巨大的经济损失。能感染包括鳗鲡(Anguillajaponica)、牙鲆(Paralichthys olivaceus)、罗非鱼(Tilapia mossambica)、大黄鱼(Larimichthys crocea)等多种鱼类。它也能使人患病,属于一种人、鱼共患病原菌,对人类健康造成巨大威胁。然而传统的迟缓爱德华氏菌检测方法,例如选择性培养基和生理生化试验检测,尽管也能检测出病原体,但是费力、费时和低灵敏度等缺点使得其不能满足病害防治的要求。
发明内容
本发明的目的是针对现有技术中存在的上述问题,提供了一种迟缓爱德华氏菌快速检测方法。
本发明的目的可通过下列技术方案来实现:一种迟缓爱德华氏菌快速检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
S01:提取待检测菌的基因组DNA;
S02:将正向引物、反向引物、RPA探针、缓冲液和步骤S01中的基因组DNA混匀后,加入冻干酶粉,振荡混匀后离心,将预混液转移到反应管中,加入启动剂进行恒等温扩增反应,得到扩增产物;
S03:将扩增产物稀释后滴加到LFD检测试纸条上的加样区,若检测线上出现颜色,则存在迟缓爱德华氏菌。
正向引物和反向引物均用于扩增迟缓爱德华氏菌目的基因。
优选地,所述的正向引物,其核苷酸序列如下:
SEQ ID NO:1,5′-CCTTTAGCAACGTGGTCGAGTTCCAGTATGA-3′(32bp)。
优选地,所述的反向引物,其核苷酸序列如下:
SEQ ID NO:2,5′-CGTTCGGATGGATCGGCGTCTTATTCTTGTTA-3′(32bp)。
优选地,所述的反向引物的5′端用生物素(Biotin)标记。
优选地,所述的RPA探针,其核苷酸序列如下:
SEQ ID NO:3,
5′-CCAAACGCCTGCGCGAGCTGTCGTTCCTTAAC/idSp/CTGGGGTTTC CATTCGC-3′。
优选地,所述的RPA探针的上游5′端用FAM标记,下游3′端进行C3Spacer修饰。
优选地,步骤S02中,所述的恒等温扩增反应,其反应条件如下:恒等温40℃温度条件下,孵育4min,拿出反应管上下颠倒8-10次,低速离心3-5s,继续孵育16min,共反应20min。
优选地,所述的启动剂为醋酸镁(MgAc)。
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