[发明专利]一种GIV.1型诺如病毒的RT-LAMP法检测用成套引物、试剂盒及检测方法有效
申请号: | 201910976389.6 | 申请日: | 2019-10-15 |
公开(公告)号: | CN110684867B | 公开(公告)日: | 2023-01-20 |
发明(设计)人: | 韩一芳;叶福强;张锦海;王太武;张琪;汪春晖;曹猛;王长军 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军东部战区疾病预防控制中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11 |
代理公司: | 南京艾普利德知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 32297 | 代理人: | 周海斌 |
地址: | 210002 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 giv 型诺如 病毒 rt lamp 检测 成套 引物 试剂盒 方法 | ||
1.一种GIV.1型诺如病毒的RT-LAMP法检测用成套引物,其特征是,所述成套引物包括外引物对GIV-F3和GIV-B3,内引物对GIV-FIP和GIV-BIP,以及环引物对GIV-LF和GIV-LB;GIV-F3的序列如SEQ ID NO:1所示,GIV-B3的序列如SEQ ID NO:2所示,GIV-FIP的序列如SEQ ID NO:3所示,GIV-BIP的序列如SEQ ID NO:4所示,GIV-LF的序列如SEQ ID NO:5所示;GIV-LB的序列如SEQ ID NO:6所示。
2.一种GIV.1型诺如病毒的RT-LAMP法检测用试剂盒,其特征是,所述试剂盒包括引物混合液,所述引物混合液含有权利要求1所述的成套引物。
3.根据权利要求2所述试剂盒,其特征是,所述外引物对GIV-F3和GIV-B3、内引物对GIV-FIP和GIV-BIP、及环引物对GIV-LF和GIV-LB的摩尔比为1:8:(2-4)。
4.根据权利要求2所述试剂盒,其特征是,所述试剂盒还包括酶液,2×反应液,显色液及超纯水。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征是,所述酶液由浓度为6-10U/μl的BstDNA聚合酶,浓度为8-16U/μl AMV逆转录酶、以及水构成;
所述2×反应液由40mmol/L pH8.8的Tris-HCl,20mmol/L的KCl,20mmol/L的(NH4)2SO4,质量浓度为0.2%的Triton X-100,由浓度均为2.8mmol/L的dATP、dTTP、dCTP、dGTP组成的dNTPs,1.6mmol/L的甜菜碱C5H11NO2,16mmol/L的MgSO4,以及水构成;
所述显色液为浓度4mmol/L的金属离子指示剂HNB储存液。
6.根据权利要求2所述试剂盒,其特征是,所述试剂盒还包括GIV.1型诺如病毒阳性对照品,浓度为20-100mg/L。
7.根据权利要求6所述试剂盒,其特征是,所述GIV.1型诺如病毒阳性对照品浓度为50mg/L,且由以下方法获得:构建含有GIV.1型诺如病毒RdRp基因的质粒,进行体外转录反应获得RdRp基因的RNA片段,纯化后即得到GIV.1型诺如病毒阳性对照品;所述RdRp基因的序列如SEQ ID NO:7所示。
8.一种非诊断目的的GIV.1型诺如病毒RT-LAMP检测方法,其特征是,采用权利要求2至7任一项所述的试剂盒;所述方法包括以下步骤:
第一步、向透明反应管加入试剂盒2×反应液、引物混合液、酶液、显色液、超纯水,然后混合获得反应液;
第二步、向反应管中加入待测核酸样品,盖好反应管后混匀;
第三步、将反应管在恒温条件下放置进行RT-LAMP扩增,再于反应结束条件下放置以终止反应;
第四步、观察反应液的颜色,若反应液颜色为天蓝色,则待测核酸样品中含有GIV.1型诺如病毒;若反应液颜色为紫罗兰色,则待测核酸样品中不含GIV.1型诺如病毒。
9.根据权利要求8所述的检测方法,其特征是,所述第二步中,加入待测核酸样品后,试剂盒2×反应液、引物混合液、酶液、显色液、超纯水及待测核酸样品的体积比为12.5:2.5:1:0.7:7.3:1,且反应管中反应液的体积为25μl;第三步中,RT-LAMP扩增条件为:62℃恒温条件下放置60min;所述反应结束的条件为:85℃下放置5min。
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