[发明专利]植物基因组DNA的提取方法、测序方法及试剂盒在审
| 申请号: | 201910898449.7 | 申请日: | 2019-09-23 |
| 公开(公告)号: | CN112538475A | 公开(公告)日: | 2021-03-23 |
| 发明(设计)人: | 杨彦;刘清正;王然;陈翠;高普霞 | 申请(专利权)人: | 武汉华大医学检验所有限公司 |
| 主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/6869 |
| 代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 张立 |
| 地址: | 430070 湖北省武汉市东湖新技术开发区高新*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 植物 基因组 dna 提取 方法 试剂盒 | ||
1.一种植物基因组DNA的提取方法,其特征在于,包括:
对植物样本进行研磨,将所得研磨粉末与细胞核提取液混合,过滤,对所得滤液进行离心,获得含有细胞核的沉淀;
利用细胞核分离液对将所述含有细胞核的沉淀进行密度梯度离心,以便获得含有细胞核的分离液;
去除所述含有细胞核的分离液中的蛋白质和RNA,获得含有DNA的溶液;
将所述含有DNA的溶液进行透析处理,以便获得所述植物基因组DNA。
2.根据权利要求1所述的提取方法,其特征在于,所述细胞核提取液为NIBMT溶液。
3.根据权利要求1所述的提取方法,其特征在于,所述过滤包括采用滤膜进行至少两次过滤处理,其中第二过滤处理的滤膜孔径小于第一过滤处理的滤膜孔径;
任选地,所述过滤包括:利用70微米孔径的滤膜进行第一过滤处理,以便获得第一过滤液;利用40微米孔径的滤膜进行第二过滤处理,以便获得第二过滤液。
4.根据权利要求1所述的提取方法,其特征在于,所述细胞核分离液为Percoll分离液。
5.根据权利要求1所述的提取方法,其特征在于,所述密度梯度离心至少包括:
采用体积分数75%的Percoll分离液和体积分数70%的Percoll分离液进行密度梯度离心。
6.根据权利要求1所述的提取方法,其特征在于,利用蛋白酶和RNA酶对所述含有细胞核的分离液进行消化处理,以便去除所述含有细胞核的分离液中的蛋白质和RNA;
任选地,所述蛋白酶为蛋白酶K溶液,所述蛋白酶K溶液含有蛋白酶K,EDTA和SDS。
7.根据权利要求1所述的提取方法,其特征在于,利用半透膜进行所述透析处理,所述半透膜的孔径大小为0.1微米;
任选地,所述透析处理的时间为16~48小时。
8.根据权利要求1所述的提取方法,其特征在于,所述植物基因组DNA大于50Kb。
9.一种植物基因组DNA提取试剂盒,其特征在于,包括:
NIBMT溶液;
Percoll分离液;
蛋白酶K溶液;
RNA酶;
半透膜;
任选地,所述试剂盒根据权利要求1~8中任一项所述的提取方法提取植物基因组DNA。
10.一种对植物基因组DNA进行测序的方法,其特征在于,包括:
利用权利要求1~8中任一项所述的提取方法提取植物样本的基因组DNA;
对所述植物基因组DNA进行文库构建,对获得的文库进行高通量测序,以便获得测序结果;
任选地,采用10X Genomics平台进行所述高通量测序。
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