[发明专利]一种快速区分非洲猪瘟病毒野毒株与基因缺失株的三重PCR检测引物及试剂盒有效
申请号: | 201910888108.1 | 申请日: | 2019-09-19 |
公开(公告)号: | CN110551853B | 公开(公告)日: | 2021-05-04 |
发明(设计)人: | 沈永义;陈瑞爱;张旭 | 申请(专利权)人: | 华南农业大学;肇庆大华农生物药品有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 郑莹 |
地址: | 510642 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 区分 非洲 猪瘟 病毒 野毒株 基因 缺失 三重 pcr 检测 引物 试剂盒 | ||
1.一种快速区分非洲猪瘟病毒野毒株与CD2V和/或360-505R基因缺失株的三重PCR检测引物组,所述检测引物的核苷酸序列如下所示:
ASFV-P72-F:5’AACCAGTGGCCCTCTCCTAT 3’(SEQ ID NO:1);
ASFV-P72-R:5’AATCGCATTGCCTCCGTAGT 3’(SEQ ID NO:2);
ASFV-CD2V-F:5’TCCTAAGCCTTACAGTCGTTATCAGT 3’(SEQ ID NO:3);
ASFV-CD2V -R:5’AGATAATGGCGGGATATTGGGTAGT 3’(SEQ ID NO:4);
ASFV-360-505R-F:5’TCTTGTCCTTTTCATACGCCTCAT 3’(SEQ ID NO:5);
ASFV-360-505R-R:5’GAGCACACCTGGGACCTCT 3’(SEQ ID NO:6)。
2.一种用于快速区分非洲猪瘟病毒野毒株与基因缺失株的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含权利要求1所述的检测引物组。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中还包括DNA提取试剂和PCR扩增试剂。
4.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中还包括阳性对照品和阴性对照品。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述阳性对照品为包含非洲猪瘟病毒P72基因的质粒DNA。
6.一种非疾病诊断目的的非洲猪瘟病毒野毒株与CD2V和/或360-505R基因缺失株的快速区分方法,其特征在于,包活以下步骤:
S1.从样品中提取病毒核酸;
S2.以核酸为模板,用权利要求1所述的检测引物组对样品进行PCR扩增反应获得扩增产物;
S3.将PCR 扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳分析,在凝胶成像系统下观察结果,确定病毒类型。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤S3所述确定病毒类型的方法为:
当无扩增产物时,则样品中没有病毒;
当扩增产物为三条片段,分别为1005,414和225bp,则样本中的病毒为野毒株;
当扩增产物为一条片段1005bp,则样本中的病毒缺失CD2V和360-505R基因;
当扩增产物为两条片段1005和414bp,则样本中的病毒缺失CD2V基因;
当扩增产物为两条片段1005和225bp,则样本中的病毒缺失360-505R基因。
8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤S2所述PCR扩增反应的反应体系包括:2×Premix rTaq 10μL,三对引物20μM 的ASFV-P72-F/R、10μM 的ASFV-CD2V-F/R、10μM 的ASFV- 360-505R-F/R各1μL,模板DNA 1μL,补加去离子水至20μL。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述2×Premix rTaq包含TaKaRa Taq酶1.25U/25μL,dNTP Mixture各0.4 mM,Taq Buffer 3 mM Mg2+,色素Marker。
10.根据权利要求6~9任一项所述的方法,其特征在于,步骤S2所述PCR扩增反应的反应条件为:95℃预变性5min;95℃变性30s,53℃退火30s,72℃延伸70s,共30~35个循环;最后72℃延伸10min。
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