[发明专利]何首乌所致肝损伤SNP位点以及在疾病预测与诊断中的应用

说明书

本发明属于分子生物学领域，具体来说，涉及一种由何首乌导致的肝损伤SNP位点，以及该SNP位点在疾病预测与诊断中的应用。本发明首先提供一种由何首乌所致肝损伤的SNP位点，所述何首乌所致肝损伤SNP位点位于HLA‑B基因上自5’端开始的第3009位，所述SNP位点碱基为G，所述位点命名为rs1055348。所述SNP位点主要由碱基T突变为碱基G。

技术领域

本发明属于分子生物学领域，具体来说，涉及一种由何首乌导致的肝损伤SNP位点，以及该SNP位点在疾病预测与诊断中的应用。

背景技术

何首乌根据炮制方法不同，分为生首乌和制首乌。2015版《中华人民共和国药典》记载生首乌解毒，消痈，截疟，润肠通便，用于疮痈，瘰疬，风疹瘙痒，久疟体虚，肠燥便秘；制首乌补肝肾，益精血，乌须发，强筋骨，化浊降脂，用于血虚萎黄，眩晕耳鸣，须发早白，腰膝酸软，肢体麻木，崩漏带下，高脂血症，是一种珍贵的中药。

然而，近年来关于何首乌所致肝损伤的报告越来越多，英国药品和健康产品管理局于2006年对何首乌肝损害不良反应发出警告，我国家食品药品监管总局亦于2014年发文提示关注口服何首乌肝损伤风险。因此，如果可以找到何首乌肝损伤的易感基因，用于预测何首乌肝损伤的发生，则可以大大降低何首乌肝损伤的发病率，有利于何首乌在临床的进一步应用及全球推广。

2019年4月份Chaopeng Li等在杂志《Hepatology》发表学术论文，证实HLA-B*35:01是何首乌所致肝损伤的危险因素，并可成为人类何首乌肝损伤的预测因素。但该研究的不足之处在于包含的例数较少，仅有26例何首乌所致肝损伤病例；再者，HLA-B基因型检测较为繁琐，检测费较贵，不利于该项检测在各大医院推广。

相较于检测HLA-B基因型，作为点突变的单核苷酸多态性(Single nucleotidepolymorphism,SNP)的检测则更为方便经济。SNP是指DNA序列上发生的单个核苷酸碱基的变异，已经发现很多基因的SNP位点与疾病有关联。大多数SNP位于基因的非编码区，其对个体表现型是无意义的，但对群体而言，这些SNP作为遗传标记在群体遗传和生物进化中有很大作用。特定DNA区域的特定SNP在特定群体中的序列验证和频率分析以及SNP与特定生理、病理状态的关系是未来的研究重点。

鉴于此，本发明团队经过艰苦的研究与探索发现一种与何首乌引起的肝损伤相关的SNP位点，可用于对何首乌易感人群的筛选，及药物性肝损伤病人的病因诊断，用药前进行筛查可降低何首乌肝损伤的发病率，有助于中药何首乌的推广。本发明的何首乌所致肝损伤的预测及诊断价值为本课题组首先发现，国内外尚无文献进行报道。

发明内容

有鉴于此，本发明的目的之一在于提供与何首乌所致肝损伤相关联的SNP位点。

为实现上述目的，本发明的技术方案为：

.何首乌所致肝损伤SNP位点，所述何首乌所致肝损伤SNP位点位于HLA-B基因自5’端开始第3009位，所述SNP位点碱基为G。将所述位点命名为rs1055348。

进一步，主要由碱基T突变为碱基G。

在人群中，携带上述突变的人服用何首乌发生肝损伤的比例会显著高于不携带此突变的人群。

进一步，所述HLA-B基因的核苷酸序列如Seq ID No.1所示。

上述何首乌所致肝损伤SNP位点在预测与诊断何首乌引起的肝损伤中的应用。

既往前瞻性队列研究发现HLA-B*3501基因分型可作为何首乌所致肝损伤的预测因子，但是HLA-B分型的检测复杂且昂贵，而本发明发现的突变位点rs1055348，其检测则更为便捷，且所需费用较少，可以大大降低检测何首乌易感性所需的费用。此外，检测SNP时只需记录全或无(+或-)，而无需像检测微卫星标记那样对片段长度做出测量，易于实现自动化分析。