[发明专利]猪病毒性腹泻病病原的五重RT-PCR检测方法有效
申请号: | 201910794842.1 | 申请日: | 2019-08-27 |
公开(公告)号: | CN110512027B | 公开(公告)日: | 2022-04-01 |
发明(设计)人: | 粟硕;张骋;潘中洲;贺微;翟晓凤 | 申请(专利权)人: | 南京农业大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 钱超 |
地址: | 210095 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 病毒性 腹泻 病原 rt pcr 检测 方法 | ||
1.猪病毒性腹泻病病原的五重RT-PCR检测方法,所述检测方法是非疾病诊断目的,其特征在于,包括如下步骤:
第一步,设计5种病毒的特异性RT - PCR检测引物对序列:
用于检测猪德尔塔冠状病毒PDCoV的引物对序列:上游引物PD - Detection F的引物序列为5’ - TACAACCTAAGGCTAACCAAC - 3’,
下游引物PD - DetectionR的引物序列为5’ - ACAACTTTACCTGCCTTACATA - 3’;
用于检测猪凸隆病毒PToV的引物对序列:
上游引物PT - Detection F的引物序列为5’ - TCCTCGTGACACTTTATCTCA - 3’,
下游引物PT - Detection R的引物序列为5’ - TTCACTAACATCCTCTACCACA - 3’;
用于检测猪流行性腹泻病毒PEDV的引物对序列:
上游引物PE - DetectionF的引物序列为5’ - TGAAGACTTTTGACAATCCAC - 3’,
下游引物PE - Detection R的引物序列为5’ - ACACAGCATTACCATCTAC - 3’;
用于检测猪急性腹泻综合征冠状病毒Sads-CoV的引物对序列:
上游引物SD - Detection F的引物序列为5’ - GCTCAGTACATCTTTTCAACT - 3’,
下游引物SD - Detection R的引物序列为5’ - CATAGTCATACTCGCTACCTT - 3’;
用于检测传染性胃肠炎病毒TGEV的引物对序列:
上游引物TG - Detection F的引物序列为5’ - TACATACCACCTGCTTATGCAA - 3’,下游引物TG - Detection R 的引物序列为5’ - TACACAATTGACCAATCAACAC - 3’;
第二步,获取待检样品的cDNA:提取腹泻粪便样品或肠道组织的总RNA,反转录为cDNA模板;
第三步,使用5对RT - PCR引物进行检测:将所述 PDCoV、PToV、PEDV、Sads-CoV和TGEV的引物对置于PCR反应体系中,以第二步中cDNA作为模板,进行PCR扩增;
第四步:用琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物,依据电泳条带出现的位置即可确定该样品中是否存在PDCoV、PToV、PEDV、Sads-CoV与TGEV;当存在148bp的条带时即可确定该样品中存在PDCoV、当存在274bp的条带时即可确定该样品中存在PToV、当存在411bp的条带时即可确定该样品中存在PEDV、当存在574bp的条带时即可确定该样品中存在Sads-CoV、当存在833bp的条带时即可确定该样品中存在TGEV。
2.根据权利要求1所述的猪病毒性腹泻病病原的五重RT-PCR检测方法,其特征在于:所述第二步中反转录使用Revert Aid First Strand cDNA Synthesis Kit进行,其反应总体系为20 µL,包括:1 µL Random Hexamer Primer, 1 µL OligodT18 Primer, 5 µLnuclease-free Water,5 µL总RNA,混匀后65 ℃孵育5 min,冰浴3 min,继续加入:4 µL5×Reaction Buffer、2 µL 10 mM dNTP预混液、1 µL RevertAid M-MuLV Reversetranscriptase和1 µL RiboLock RNase Inhibitor。
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