[发明专利]一种细胞运动数据处理装置及方法在审
申请号: | 201910782121.9 | 申请日: | 2019-08-23 |
公开(公告)号: | CN110705014A | 公开(公告)日: | 2020-01-17 |
发明(设计)人: | 张智红;刘征;曾凡新;任世杰;骆清铭 | 申请(专利权)人: | 华中科技大学 |
主分类号: | G06F30/20 | 分类号: | G06F30/20 |
代理公司: | 11570 北京众达德权知识产权代理有限公司 | 代理人: | 张桂蓉 |
地址: | 430074 湖北*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 运动轨迹 追踪 多维运动 特性参数 细胞运动 细胞 参数处理模块 参数计算模块 数据处理装置 数据导入模块 定量分析 参数处理 参数分析 数据表征 数据计算 数据通过 运动状态 | ||
本发明公开了一种细胞运动数据处理装置及方法,该装置包括:数据导入模块,用于导入细胞的运动轨迹追踪数据,运动轨迹追踪数据表征细胞在不同环境中的运动状态,运动轨迹追踪数据通过追踪细胞在不同环境中的运动轨迹得到;参数计算模块,用于根据运动轨迹追踪数据计算出多维运动特性参数;参数处理模块,用于根据预选的参数处理项对所述多维运动特性参数进行定量分析,得到对应的参数分析结果,从而,解决了现有技术中对细胞运动特性的描述不够全面、准确的技术问题。
技术领域
本发明涉及数据处理领域,尤其涉及一种细胞运动数据处理装置及方法。
背景技术
活体光学显微成像技术的迅速发展,推动了免疫学家们对免疫细胞运动行为的探索。对免疫细胞运动行为特征的研究,以及对细胞成像获取的频域、时域、空间域多维数据的提取和处理,为揭示免疫过程的调节机制提供至关重要的时空动态信息。然而,对免疫细胞运动数据的处理与对行为参数的分析仍然面临着巨大挑战。一方面,海量的数据如果使用人工分析,是一项耗时且繁琐的工作。虽然目前已经有多款针对细胞运动轨迹提取的商业软件如Imaris、Volocity和Image J等,但这些软件并没有对细胞运动行为特征做进一步的分析。另一方面,准确的分析方法和参数对解析细胞迁移的规律至关重要,是建立更加符合实际运动情况的细胞运动模型的关键。
目前,传统的用于细胞运动行为分析的参数如瞬时速度、停滞系数、位移、平均速度等还不能够全面、准确地描述细胞运动的特征,不能为研究者判断细胞运动行为所遵循的规律提供有力的依据。
发明内容
至少为了解决现有技术中对细胞运动特性的描述不够全面、准确的技术问题,本发明实施例提供了一种细胞运动数据处理方法及装置。
第一方面,本发明实施例提供一种细胞运动数据处理装置,包括:
数据导入模块,用于导入细胞的运动轨迹追踪数据,所述运动轨迹追踪数据表征所述细胞在不同环境中的运动状态,所述运动轨迹追踪数据通过追踪所述细胞在不同环境中的运动轨迹得到;
参数计算模块,用于根据所述运动轨迹追踪数据计算出细胞多维运动特性参数;
参数处理模块,用于根据从多种参数处理项中预选的参数处理项,对所述多维运动特性参数进行定量分析,得到对应的参数分析结果。
可选的,所述参数处理模块,包括:
比较分析单元,用于对所述多维运动特性参数进行比较分析,获得数据分析结果;
保存展示单元,用于保存和/或展示所述数据分析结果。
可选的,所述比较分析单元,包括:
参数分析子单元,用于对所述多维运动特性参数进行分析,获得表征所述细胞运动行为的运动分析结果数据;
绘制子单元,用于对所述运动分析结果数据绘制细胞运动分析曲线。
可选的,所述绘制子单元,具体用于:
获取所述细胞的光学显微成像中相邻图像帧之间的固定时间间隔,并根据所述固定时间间隔确定绘制时间间隔;
根据所述运动轨迹追踪数据确定运动轨迹坐标;
基于所述绘制时间间隔、所述绘图坐标和所述运动轨迹坐标参数,绘制所述细胞的原始细胞轨迹图和/或原点归一化细胞轨迹图。
可选的,所述绘制子单元,具体用于:
从所述多维运动特性参数中确定位移参数;
根据所述位移参数绘制所述细胞的归一化频率分布图。
可选的,所述绘制子单元,具体用于:
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