[发明专利]一种基于翻译组的环状RNA翻译多肽的检测分析方法

权利要求书

1.一种基于翻译组的环状RNA翻译多肽的检测分析方法，其特征在于，包括如下内容：

S1、将样本高通量测序获得的高质量比对序列进行TopHat比对以及鉴定，将鉴定结果过滤后，获得环状RNA序列信息；

S2、对S1获得的环状RNA序列信息进行ORF注释；

S3、对S1获得的环状RNA序列信息进行IRES预测；

S4、结合ribosome-seq测序数据鉴定内源性circRNA翻译产物；

S5、对单样本检测到S4获得的具有junction reads的circRNA的母基因进行GO和KEGG富集分析。

2.如权利要求1所述的检测分析方法，其特征在于，所述步骤S1中获得的高质量比对序列通过以下方法实现：得到下机数据后，将数据进行过滤、比对核糖体，得到High qualityclean reads。

3.如权利要求2所述的检测分析方法，其特征在于，所述对下机的clean reads进行过滤，其步骤及参数如下：去除含adapter的reads和除含N比例大于10％的reads以及低质量的reads。

4.如权利要求2所述的检测分析方法，其特征在于，所述对下机的得到的High qualityclean reads进行比对核糖体的方法包括以下步骤：首先将高质量比对序列比对到核糖体数据库，去除比对上核糖体的reads。

5.如权利要求1所述的检测分析方法，其特征在于，所述步骤S1中将获得的高质量比对序列进行TopHat比对及鉴定的方法包括以下步骤：将每个样本的高质量比对序列与参考基因组分别进TopHat比对，从比对结果中提取Unmapped Reads，然后截取每一条UnmappedReads的两端，得到Anchors Reads，再用Anchors Reads再一次比对到参考基因组上，将所有样本的比对结果进行合并，将合并后的结果后使用find_circ软件进行环状RNA鉴定。

6.如权利要求1所述的检测分析方法，其特征在于，所述步骤S2中进行ORF注释通过以下方法实现：利用cORF pipeline脚本针对circRNA进行ORF注释，获得注释结果统计图表，寻找具有编码能力能力的circRNA。

7.如权利要求1所述的检测分析方法，其特征在于，所述步骤S3中IRES预测通过以下方法实现：利用IRESfinder搜索真核细胞内RNA的核心IRES区域，采用划窗模式对每一小段的序列进行预测获得评分，得分最高的区域被认为是该circRNA的IRES序列。

8.如权利要求1所述的检测分析方法，其特征在于，所述步骤S4中鉴定内源性circRNA翻译产物通过以下方法实现：将样本的ribosome-seq数据比对参考基因组，截取环状RNAjunction位点的前后juntion序列，寻找可以比对junction位点的reads，找出潜在支持环状RNA翻译的reads，并统计reads数。