[发明专利]一种高灵敏、快速定量检测T4 PNK酶的方法在审
申请号: | 201910738896.6 | 申请日: | 2019-08-12 |
公开(公告)号: | CN110514631A | 公开(公告)日: | 2019-11-29 |
发明(设计)人: | 胡琴;岑瑶;柴煜莹;许贯虹;魏芳弟;杨静 | 申请(专利权)人: | 南京医科大学 |
主分类号: | G01N21/64 | 分类号: | G01N21/64 |
代理公司: | 32200 南京经纬专利商标代理有限公司 | 代理人: | 曹翠珍<国际申请>=<国际公布>=<进入 |
地址: | 210029 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 荧光 裂解 灵敏 退火 荧光素标记 催化磷酸 定量检测 多核苷酸 合成金属 快速定量 配位中心 有机骨架 有机配体 激酶 互补链 磷酸化 酶活性 检测 双链 猝灭 培育 | ||
本发明公开了一种高灵敏、快速定量检测T4多核苷酸激酶的方法,步骤是:(1)以Fe3+为配位中心,BDC为有机配体,合成金属有机骨架Fe‑MIL‑88;(2)将荧光素标记的DNA单链FAM‑ssDNA与其互补链退火形成双链FAM‑dsDNA;(3)FAM‑dsDNA经培育后,被T4 PNK催化磷酸化,磷酸化的FAM‑dsDNA被λ exo裂解得到FAM‑ssDNA;(4)加入Fe‑MIL‑88,裂解得到FAM‑ssDNA荧光被猝灭,通过检测FAM的荧光强度来定量检测T4 PNK酶活性。灵敏简便,选择性好。
技术领域
本发明属纳米材料、荧光传感技术和生物分析检测领域,具体涉及基于偶联核酸外切酶反应和金属有机骨架(MOFs)—Fe-MIL-88的荧光传感纳米平台用于定量测定细胞裂解液中T4多核苷酸激酶(T4 PNK)的方法。
背景技术
T4多核苷酸激酶(T4 PNK)是由T4噬菌体所感染的大肠杆菌分离出来的酶。多核苷酸激酶(PNK)能够催化三磷酸腺苷(ATP)的γ-磷酸基团转移到DNA或RNA的5′-OH末端并生成ADP的反应。在大多数正常的细胞活动包括DNA重组、复制、修复过程中,该磷酸化反应是一个必不可少的过程。一般来说,各种外源性和内源性因素包括电离辐射、化学物质和核酸酶等都可能导致核酸中5'端羟基化,从而损伤DNA,使基因组不稳定。多核苷酸激酶通过转移ATP的γ-磷酸基团至DNA末端从而负责修复核酸的5′端羟基自由基。PNK功能障碍可能导致许多细胞活动发生异常,如核酸代谢、DNA复制、DNA重组、DNA链损伤修复异常等,最终诱发多种人类疾病,包括沃纳综合征、Rothmund-Thomson综合征等。此外,由于PNK抑制剂能够提高人体肿瘤对γ-射线的敏感性,PNK可能为癌症放射治疗的一个有重大潜力的靶点。因此,建立一种高灵敏性,选择性好,便于操作的PNK活性检测及其抑制剂筛选的方法对基础生化研究、临床诊断和药物发现具有重要意义。
目前,用于检测PNK活性的常规分析方法主要包括聚丙烯酰胺凝胶电泳、放射自显影、自由基同位素32p标记技术等,但这些方法存在复杂、耗时、潜在的放射性危害等缺陷。近年来,纳米通道生物传感器、电化学方法、比色法、荧光法等逐渐引起关注,其中荧光法以其简便、高效、灵敏等优点越来越受到人们的重视。
近年来,金属有机骨架材料(MOFs)作为一种具有晶体多孔性的新型材料,以其生物降解性、高比表面积和灵活可控的孔隙度,显示出了巨大的应用潜力。MOFs的常见应用包括气体储存、催化和药物传递。此外,利用MOFs具有良好的猝灭能力,可以用于构建荧光传感平台。MOFs通常对单链DNA(ssDNA)显示良好的吸附作用。这是由于MOFs包含的有机基团通常存在π电子共轭体系产生π-π相互作用的结果,同时为可能的氢键提供来源。然而,利用MOFs进行酶活性检测的例子很少,因此利用MOFs进行酶活性检测的应用尚待进一步探索。
发明内容
针对现有技术存在的设计复杂、操作繁琐、费用高等缺陷,本发明的目的在于提供一种基于偶联核酸外切酶反应和MOFs(Fe-MIL-88)的用于高灵敏、快速定量检测T4多核苷酸激酶的方法。利用λ exo对磷酸化DNA的裂解作用、Fe-MIL-88对ssDNA和双链DNA(dsDNA)的吸附能力的明显区别及其良好的荧光猝灭能力,检测细胞裂解液中T4 PNK酶活性。
为了实现上述发明目的,本发明采用的技术方案为:
一种快速定量检测T4 PNK酶的方法,步骤如下:
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