[发明专利]一种捕获核酸分子的方法及其应用在审
申请号: | 201910733022.1 | 申请日: | 2019-08-09 |
公开(公告)号: | CN112342269A | 公开(公告)日: | 2021-02-09 |
发明(设计)人: | 李改玲;甘广丽;李妍;骆明杰;张萌;孙雷 | 申请(专利权)人: | 深圳市真迈生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12Q1/6869;C12N15/10;C40B50/06 |
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地址: | 518024 广东省深圳市罗湖区清水*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 捕获 核酸 分子 方法 及其 应用 | ||
1.一种捕获核酸分子的方法,其特征在于,所述核酸分子包括互补的第一核酸链和第二核酸链,所述核酸分子具有至少一个单链末端,至少一个所述单链末端位于所述第一核酸链上,该方法包括:
利用探针捕获所述核酸分子,使所述探针和所述第一核酸链上的至少一部分互补结合,以获得杂交复合体,所述第一核酸链上的至少一部分包含所述单链末端。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述单链末端位于所述第一核酸链的3’端;
任选地,所述探针为寡核苷酸单链;
任选地,所述探针的长度为20~80nt;
任选地,所述探针的3’末端的核苷酸含有羟基;
任选地,所述探针固定在固体介质上,所述固体介质选自玻璃、塑料和磁珠中的至少一种。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述核酸分子通过连接第一核酸片段和第二核酸片段而获得,所述第一核酸片段和所述第二核酸片段均为双链DNA,所述第一核酸片段为已知序列,所述第一核酸片段包括互补的第一链和第二链,所述单链末端位于所述第一链上;
任选地,所述第一核酸片段和所述第二核酸片段通过平末端连接和/或粘性末端连接以获得所述核酸分子;
任选地,所述第一链的5'端具有磷酸基团;
任选地,所述第二链的3’端无羟基。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,80℃≥(Tm1-Tm2)≥10℃并且90℃≥Tm1≥50℃,Tm1为所述第一链的溶解温度,Tm2为所述第二链的溶解温度;
任选地,所述第一链的所有序列与探针互补配对;
任选地,所述Tm1为71℃,Tm2=45.6℃;
任选地,Tm2-5℃≤T≤Tm1-5℃,T为进行所述捕获的温度;
任选地,所述第一链的3’端带有光学可检测标记;任选地,所述光学可检测标记为荧光分子。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述方法还包括在进行所述捕获之前,使所述核酸分子解链为单链核酸分子。
6.一种杂交复合体,其特征在于,所述的杂交复合体通过权利要求1-5任一所述的方法获得。
7.一种试剂盒,包括权利要求1-5任一所述的核酸分子。
8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包含所述探针;
任选地,所述试剂盒还包括所述杂交复合体。
9.权利要求7或8所述的试剂盒在序列杂交捕获和/或测序中的用途。
10.一种测序方法,其特征在于,包括对杂交复合体进行序列测定,所述杂交复合体利用权利要求1-5任一所述的方法获得。
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