[发明专利]一种与三疣梭子蟹生长性状相关的微卫星标记、其引物及应用有效

专利信息
申请号: 201910704471.3 申请日: 2019-07-31
公开(公告)号: CN110484629B 公开(公告)日: 2022-11-18
发明(设计)人: 康现江;段保华;管越强;穆淑梅;姬新东;李泽健;李书琴;李彦芹 申请(专利权)人: 河北大学
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12N15/11
代理公司: 石家庄国域专利商标事务所有限公司 13112 代理人: 苏艳肃
地址: 071002 河北*** 国省代码: 河北;13
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摘要:
搜索关键词: 一种 梭子蟹 生长 性状 相关 卫星 标记 引物 应用
【说明书】:

发明提供了一种与三疣梭子蟹生长性状相关的微卫星标记、其引物及应用,微卫星标记包括微卫星标记ZL03、ZL05、ZL06、ZL08和NC07;本发明还提供了上述的微卫星标记或其引物在三疣梭子蟹生长性状分析以及三疣梭子蟹分子育种中的应用。本发明提供的微卫星标记的引物具有PCR扩增结果稳定的特点,其微卫星标记可以用于三疣梭子蟹生长性状分析,可以辅助三疣梭子蟹分子标记育种。

技术领域

本发明涉及三疣梭子蟹生物学遗传育种领域,具体地说是一种与三疣梭子蟹生长性状相关的微卫星标记、其引物及应用。

背景技术

SSR(Simple sequence repeat)即简单序列重复,又称为微卫星DNA(microsatellite DNA),在真核生物基因组中,SSR仅由几个核有酸(1-6个)组成重复单位,如((CT)n,(AC)n,(ACT)n(其中n为重复次数)等,重复次数10-20,同一类微卫星DNA可分布在整个基因组不同位置上,由于重复次数的不同,或重复程度的不完全,而形成每个座位的多态性。每类微卫星DNA两端的序列多是相对保守的单拷贝序列,可根据两端序列设计一对特异引物,扩增每个位点微卫星序列。

目前,SSR也是发展最快、应用最广的一类标记。SSR标记具有以下特点:①在真核生物基因组中广泛分布,大约每隔10-15kb就存在一个微卫星标记;②数量多,具有丰富的多态性;③具有多等位基因的特性,信息含量大;④呈共显性遗传,即能区分纯合子和杂合子;⑤等位基因的分离遵循孟德尔规律;⑥实验操作简单、结果稳定可靠;⑦基于PCR技术,可实现自动化检测;⑧具有连锁不平衡现象;⑨重复性较好。因此,微卫星标记技术目前已广泛地应用于生物DNA指纹图谱、种质资源的鉴定、遗传连锁图谱的构建、遗传多样性、等位基因变异和遗传关系及遗传结构等方面。

三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)是一种重要的海洋经济蟹类,北起中国辽东半岛、南至广东沿海,以及日本、朝鲜、马来群岛、红海等海域均有分布。1981年三疣梭子蟹被列为我国海洋水产养殖对象。近年来由于过度捕捞和环境污染造成三疣梭子蟹野生资源减少,养殖过程中各种病害不断发生。目前,沿海地区工业污染导致水质变差,由此使三疣梭子蟹生存环境遭到破坏,优质亲本数量急剧减少,养殖面积大幅度下降。因此,开发针对分析三疣梭子蟹遗传结构的微卫星引物,采用分子遗传标记的手段分析三疣梭子蟹种质资源现状,研究其种群遗传学以及利用分子标记进行育种,这对了解三疣梭子蟹的遗传多样性和种群结构、有效保护三疣梭子蟹野生资源、开发良种以及保育原种,对生物多样性的保护和生物资源的可持续利用具有重要意义。

发明内容

本发明的目的就是提供一种与三疣梭子蟹生长性状相关的微卫星标记、其引物及应用,以提供一套三疣梭子蟹生长性状结构分析的微卫星引物,为三疣梭子蟹遗传多样性、种质资源现状的调查研究以及分子生物学育种提供依据。

本发明的目的是通过以下技术方案实现的:一种与三疣梭子蟹生长性状相关的微卫星标记,包括微卫星标记ZL03、ZL05、ZL06、ZL08和NC07;

所述微卫星标记ZL03与三疣梭子蟹的背甲宽、内背甲宽、第八对棘背甲宽、背甲长、背甲底宽、腹甲宽、腹部宽、体厚和体重性状相关联,其序列如SEQ ID NO.1所示;

所述微卫星标记ZL05与三疣梭子蟹的背甲宽、内背甲宽、第八对棘背甲宽、背甲长、背甲底宽、腹甲宽、腹部宽、体厚和体重性状相关联,其序列如SEQ ID NO.2所示;

所述微卫星标记ZL06与三疣梭子蟹的鳌肢掌节长和鳌肢长节长性状相关联,其序列如SEQ ID NO.3所示;

所述微卫星标记ZL08与三疣梭子蟹的背甲宽、内背甲宽、第八对棘背甲宽、背甲长、背甲底宽、腹甲宽、腹部宽和体重性状相关联,其序列如SEQ ID NO.4所示;

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