[发明专利]一种与番茄果实颜色相关的染色体结构变异分子标记、特异引物及其应用

权利要求书

1.鉴定番茄杂交后代是否具有白色果实及是否为杂合状态的特异引物，其特征在于，所述特异引物包括两对正反向引物，其中一对正反向引物扩增出来的序列跨越突变体基因组上的倒位位点，另一对正反向引物扩增出来的序列跨越正常番茄基因组上的倒位位点，所述倒位位点：以SL2.50版本的番茄参考基因组为准，为10号染色体上的第62527986碱基位点，其中白果突变体10号染色体的第62736140碱基到第62527986碱基之间存在208kb的倒位。

2.根据权利要求1所述的鉴定番茄杂交后代是否具有白色果实及是否为杂合状态的特异引物，其特征在于，扩增出来的序列跨越白果突变体基因组上的倒位位点的正反向引物为SH1,扩增出来的序列跨越正常番茄基因组上的倒位位点的正反向引物为SH2,其中SH1、SH2的核苷酸序列为：

SH1正向引物SH1-FW：5-AGCTCGCTTACCGGCTTTGT-3；

SH1反向引物SH1-RV：5-TGGACAATGATTGGATATGTGAGA-3；

SH2正向引物SH2-FW：5-TTGTGATTGCTGGCTGGTAAA-3；

SH2反向引物SH2-RV：5-TCAAAAGGTGGTTACAAGACCTATA-3。

3.一种鉴定番茄杂交后代是否为白色果实的方法，其特征在于，包括以下步骤：

(1)提取待测样本的基因组DNA；

(2)PCR扩增，以待检测的番茄基因组DNA为模板，利用权利要求2所述的两对引物SH1和SH2分别进行PCR扩增；

(3)PCR扩增产物的琼脂糖凝胶电泳检测，若样品仅能检测到SH1的986bp条带，该样品为白果突变体带型；若样品仅能检测到SH2的1548bp条带，该样品为野生型带型；若样品能同时检测到SH1的986bp条带和SH2的1548bp条带，则该样品为杂合带型，突变体带型的植株果实为白色。

4.权利要求1所述的鉴定番茄杂交后代是否具有白色果实及是否为杂合状态的特异引物在番茄育种中的应用。

5.权利要求3所述的鉴定番茄杂交后代是否为白色果实的方法在番茄育种中的应用。